ข้อมูล

23.16: ระบบเสริม - ชีววิทยา

23.16: ระบบเสริม - ชีววิทยา



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

โปรตีนที่ละลายน้ำได้ประมาณ 20 ชนิด เรียกว่า a ระบบเสริม, ทำหน้าที่ทำลายเชื้อโรคนอกเซลล์ หลังจากที่โปรตีนคอมพลีเมนต์สองสามตัวแรกจับกัน น้ำตกของเหตุการณ์การจับตามลำดับจะตามมาซึ่งเชื้อโรคจะเคลือบด้วยโปรตีนคอมพลีเมนต์อย่างรวดเร็ว

โปรตีนเสริมทำหน้าที่หลายอย่าง โปรตีนทำหน้าที่เป็นเครื่องหมายเพื่อบ่งชี้การมีอยู่ของเชื้อโรคต่อเซลล์ฟาโกไซติก เช่น มาโครฟาจและเซลล์บี และเพิ่มการกลืนกิน กระบวนการนี้เรียกว่า opsonization. Opsonization หมายถึงกระบวนการภูมิคุ้มกันที่อนุภาคเช่นแบคทีเรียมีเป้าหมายเพื่อการทำลายโดยเซลล์ภูมิคุ้มกันที่เรียกว่า phagocyte โปรตีนเสริมบางชนิดสามารถรวมกันเพื่อสร้างคอมเพล็กซ์โจมตีที่เปิดรูขุมขนในเยื่อหุ้มเซลล์ของจุลินทรีย์ โครงสร้างเหล่านี้ทำลายเชื้อโรคโดยทำให้เนื้อหารั่วไหล ดังแสดงในรูปที่ 1

รูปที่ 1 คลิกเพื่อดูภาพขนาดใหญ่ ทางเดินแบบคลาสสิกสำหรับส่วนประกอบเสริมเกี่ยวข้องกับการยึดติดของโปรตีนส่วนประกอบเริ่มต้นหลายตัวกับเชื้อโรคที่จับกับแอนติบอดี ตามด้วยการกระตุ้นอย่างรวดเร็วและการจับตัวของโปรตีนส่วนประกอบอื่นๆ อีกมากมาย และการสร้างรูพรุนที่ทำลายล้างในซองเซลล์จุลินทรีย์และผนังเซลล์ วิถีทางเลือกไม่เกี่ยวข้องกับการกระตุ้นแอนติบอดี ในทางกลับกัน C3 convertase จะทำลาย C3 ตามธรรมชาติ โปรตีนควบคุมภายในจะป้องกันสารเชิงซ้อนจากการผูกมัดกับเซลล์เจ้าบ้าน เชื้อโรคที่ขาดโปรตีนควบคุมเหล่านี้จะถูกสลาย (เครดิต: การปรับเปลี่ยนงานโดย NIH)


นิเวศวิทยาของตัวอ่อน: พัฒนาการซิงโครไนซ์และอะซิงโครไนซ์ในการพัฒนาตัวอ่อนของประชากรปลาประจำปีในป่า

Matej Polačik, Institute of Vertebrate Biology, The Czech Academy of Sciences, เบอร์โน, สาธารณรัฐเช็ก

ผลงาน: แนวความคิด (เท่ากัน), การจัดการข้อมูล (เท่ากัน), การวิเคราะห์อย่างเป็นทางการ (เท่ากัน), การจัดหาเงินทุน (เท่ากับ), ​การสืบสวน (เท่ากับ), ระเบียบวิธี (เท่ากับ), การบริหารโครงการ (เท่ากัน), การกำกับดูแล (เท่ากับ), การแสดงภาพ (เท่ากับ ), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน), การเขียน - ทบทวนและแก้ไข (เท่ากัน)

Institute of Vertebrate Biology, The Czech Academy of Sciences, เบอร์โน, สาธารณรัฐเช็ก

ผลงาน: แนวความคิด (เท่ากัน), การจัดการข้อมูล (เท่ากัน), การวิเคราะห์อย่างเป็นทางการ (เท่ากัน), ​สืบสวน (เท่ากัน), ระเบียบวิธี (เท่ากับ), การแสดงภาพ (เท่ากัน), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน), การเขียน - ทบทวนและแก้ไข (เท่ากัน) )

Institute of Vertebrate Biology, The Czech Academy of Sciences, เบอร์โน, สาธารณรัฐเช็ก

ผลงาน: สืบสวน (เท่ากัน), ระเบียบวิธี (เท่ากัน), กำกับดูแล (เท่ากัน), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน)

Institute of Vertebrate Biology, The Czech Academy of Sciences, เบอร์โน, สาธารณรัฐเช็ก

Department of Zoology, Charles University, Prague, สาธารณรัฐเช็ก

ผลงาน: แนวความคิด (เท่ากัน), การจัดการข้อมูล (เท่ากัน), การวิเคราะห์อย่างเป็นทางการ (เท่ากัน), ​สืบสวน (เท่ากัน), ระเบียบวิธี (เท่ากัน), การสร้างภาพ (เท่ากัน), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน)

Institute of Vertebrate Biology, The Czech Academy of Sciences, เบอร์โน, สาธารณรัฐเช็ก

ผลงาน: แนวความคิด (เท่ากัน), ​สืบสวน (เท่ากัน), ระเบียบวิธี (เท่ากัน), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน), การเขียน - ทบทวนและแก้ไข (เท่ากัน)

Center for Life in Extreme Environments, Portland State University, Portland, OR, USA

ผลงาน: แนวความคิด (เท่ากัน), ​สืบสวน (เท่ากัน), ระเบียบวิธี (เท่ากัน), ทรัพยากร (เท่ากัน), การตรวจสอบความถูกต้อง (เท่ากัน), การแสดงภาพ (เท่ากัน), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน), การเขียน - ทบทวนและแก้ไข (เท่ากัน)

Institute of Vertebrate Biology, The Czech Academy of Sciences, เบอร์โน, สาธารณรัฐเช็ก

Matej Polačik, Institute of Vertebrate Biology, The Czech Academy of Sciences, เบอร์โน, สาธารณรัฐเช็ก

ผลงาน: แนวความคิด (เท่ากัน), การจัดการข้อมูล (เท่ากัน), การวิเคราะห์อย่างเป็นทางการ (เท่ากัน), การจัดหาเงินทุน (เท่ากับ), ​การสืบสวน (เท่ากับ), ระเบียบวิธี (เท่ากับ), การบริหารโครงการ (เท่ากัน), การกำกับดูแล (เท่ากับ), การแสดงภาพ (เท่ากับ ), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน), การเขียน - ทบทวนและแก้ไข (เท่ากัน)

Institute of Vertebrate Biology, The Czech Academy of Sciences, เบอร์โน, สาธารณรัฐเช็ก

ผลงาน: แนวความคิด (เท่ากัน), การจัดการข้อมูล (เท่ากัน), การวิเคราะห์อย่างเป็นทางการ (เท่ากัน), ​สืบสวน (เท่ากัน), ระเบียบวิธี (เท่ากับ), การแสดงภาพ (เท่ากัน), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน), การเขียน - ทบทวนและแก้ไข (เท่ากัน) )

Institute of Vertebrate Biology, The Czech Academy of Sciences, เบอร์โน, สาธารณรัฐเช็ก

ผลงาน: สืบสวน (เท่ากัน), ระเบียบวิธี (เท่ากัน), กำกับดูแล (เท่ากัน), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน)

Institute of Vertebrate Biology, The Czech Academy of Sciences, เบอร์โน, สาธารณรัฐเช็ก

Department of Zoology, Charles University, Prague, สาธารณรัฐเช็ก

ผลงาน: แนวความคิด (เท่ากัน), การจัดการข้อมูล (เท่ากัน), การวิเคราะห์อย่างเป็นทางการ (เท่ากัน), ​สืบสวน (เท่ากัน), ระเบียบวิธี (เท่ากัน), การสร้างภาพ (เท่ากัน), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน)

Institute of Vertebrate Biology, The Czech Academy of Sciences, เบอร์โน, สาธารณรัฐเช็ก

ผลงาน: แนวความคิด (เท่ากัน), ​สืบสวน (เท่ากัน), ระเบียบวิธี (เท่ากัน), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน), การเขียน - ทบทวนและแก้ไข (เท่ากัน)

Center for Life in Extreme Environments, Portland State University, Portland, OR, USA

ผลงาน: แนวความคิด (เท่ากัน), ​สืบสวน (เท่ากัน), ระเบียบวิธี (เท่ากัน), ทรัพยากร (เท่ากัน), การตรวจสอบความถูกต้อง (เท่ากัน), การแสดงภาพ (เท่ากัน), การเขียน - ร่างต้นฉบับ (เท่ากัน), การเขียน - ทบทวนและแก้ไข (เท่ากัน)


ชีวเคมีทางการแพทย์ (ฉบับที่ 4): Bhagavan, N. V.

Bhagavan, N. V. Harcourt/Academic Press, 2002, 1016 pp., ISBN 0-12-095440-0, $79.95

หนังสือของ Bhagavan รุ่นแรกปรากฏในปี 1974 และฉบับล่าสุดนี้มีการปรับปรุงอย่างกว้างขวาง นอกจากศาสตราจารย์ภควันเองแล้ว ยังมีผู้มีส่วนร่วมสำคัญเจ็ดคน และผู้ตรวจสอบอีกโหลหรือมากกว่านั้น การนำเสนอหัวข้อมีความสมเหตุสมผลและเป็นแบบดั้งเดิม ดังนั้น บทที่ 1 เริ่มต้นด้วยการอภิปรายเกี่ยวกับคุณสมบัติของน้ำและกรด เบส และบัฟเฟอร์ ไม่มีการแนะนำอย่างอ่อนโยนที่เราถูกโยนลงไป ในลักษณะที่เป็นลักษณะเฉพาะของแนวทางทั้งหมดในหนังสือเล่มนี้ จะให้ข้อมูลและความเชื่อมโยงทางการแพทย์สำหรับนักศึกษาแพทย์ที่มีงานยุ่งและเป็นผู้ใหญ่ โดยมีการจีบหรือขอโทษด้วยดอกไม้ที่ต้องเข้าใจสิ่งนี้

ข้อความถูกรวมเข้าด้วยกันในระดับปานกลาง แต่ไม่ต้องสงสัยเลยว่าเป็นชีวเคมี ฉันคิดว่านักเรียนหลายคนจะพบว่าแนวทางนี้น่าพอใจมาก พวกเขาต้องการเรียนรู้เนื้อหาที่สำคัญและเห็นความเกี่ยวข้อง การแบ่งหัวข้อระหว่างบทต่าง ๆ ได้รับการออกแบบสำหรับแพทย์ด้วย ดังนั้นวิตามินจะได้รับการจัดการในบทที่แยกจากกันแทนที่จะรวมเข้ากับการเผาผลาญ ฯลฯ และฮอร์โมนจะถูกแบ่งออกเป็นบทที่แยกจากกันเกี่ยวกับสเตียรอยด์ ไฮโปทาลามัสและต่อมใต้สมอง ต่อมหมวกไต ไทรอยด์ และระบบสืบพันธุ์ มากกว่าตามโหมดทางชีวเคมีของพวกมัน ของการกระทำ (เช่น. ปฏิกิริยาระหว่าง G-โปรตีน ตัวรับสังกะสีในเซลล์)

ไดอะแกรมก็อยู่ด้านที่เรียบง่ายเป็นส่วนใหญ่ ไม่มีศิลปินคนไหนที่ปล่อยให้หลวมด้วยจานสีสี่สีซึ่งใช้งานได้ทั้งหมด อันที่จริงหนังสือเล่มนี้พิมพ์ส่วนใหญ่เป็นด้านหลังและสีขาว โดยมีการเพิ่มสีแดงบางส่วนที่ใช้เท่าที่จำเป็นในบางไดอะแกรม อย่างไรก็ตาม มีชุดภาพสีบนกระดาษเคลือบมันซึ่งจัดกลุ่มไว้ในส่วนแยกต่างหาก (น่าจะเป็นมาตรการทางเศรษฐกิจ) ที่เกี่ยวข้องกับบทที่ 35 และ 36 เกี่ยวกับภูมิคุ้มกันวิทยาระดับโมเลกุลและการแข็งตัวของเลือด ซึ่งเขียนขึ้นโดยหนึ่งในผู้เขียนที่ร่วมให้ข้อมูล ตัวเลขเหล่านี้ยังปรากฏในตำแหน่งที่เหมาะสมในข้อความเป็นภาพขาวดำ (ค่อนข้างน่ากลัว) แต่จากนั้นคุณสามารถเปลี่ยนไปยังหน้าพิเศษเหล่านี้สำหรับเวอร์ชันสีได้ เหล่านี้ส่วนใหญ่เป็นแบบแผนและโครงสร้างโมเลกุล อันที่จริงฉันไม่แน่ใจว่าแพทย์จำเป็นต้องรู้โครงสร้างสามมิติของโปรตีนมากแค่ไหน (หนังสือเล่มนี้ไม่มีซีดีรอม) ตัวอย่างเช่น ภายใต้ไทรอยด์ เรามีโครงสร้างโมเลกุลที่ค่อนข้างเก่าและน่าสงสัยของ T4 (และบทนี้อาจจะไม่ทันสมัยกว่าบทอื่นๆ) และอาจมีคนถามว่าทำไมเราถึงต้องการโครงสร้างที่แตกต่างกันสามแบบสำหรับทาโครลิมัสในบทภูมิคุ้มกันวิทยา ฉันคิดว่าไมโครกราฟและไมโครกราฟอิเล็กตรอนโดยทั่วไปจะมีประโยชน์มากกว่าและมีสิ่งเหล่านี้ค่อนข้างน้อยและบางอันก็แย่จนไร้ประโยชน์ (เช่น. โพลิโซมในรูปที่ 25–15) รูปภาพบางรูปที่ยืมมาจากสิ่งพิมพ์อื่นๆ ออกมาค่อนข้างแย่ และพวกเขาก็อาจได้ประโยชน์จากการวาดใหม่เช่นกัน ตัวอย่างของตัวเลขที่น่าสงสารเหล่านี้คือรูปภาพของโครงสร้างตับในหน้า 200 (แน่นอนว่าสำคัญมากสำหรับแพทย์ แต่บางทีพวกเขาอาจเข้าใจในการศึกษากายวิภาคศาสตร์) และรูปที่ 23–16, 15–19 และ 28–11 เพื่อตั้งชื่อว่า จำนวนน้อย.

ลำดับหัวข้อมีดังนี้ กรดอะมิโน โปรตีน เทอร์โมไดนามิกส์และจลนศาสตร์ เอนไซม์ คาร์โบไฮเดรต (การย่อยและการดูดซึม) ไกลโคไลซิสและวัฏจักร TCA การเผาผลาญของไกลโคเจน โปรตีนและกรดอะมิโน เมแทบอลิซึม ไขมัน โคเลสเตอรอล การหดตัวของกล้ามเนื้อ สภาวะสมดุลเมตาบอลิซึม , DNA, ฯลฯ (ตอนนี้อยู่ครึ่งทางแล้ว), การควบคุมการแสดงออกของยีน, เมแทบอลิซึมของนิวคลีโอไทด์, เฮโมโกลบิน, เมแทบอลิซึมของธาตุเหล็กและฮีม, ต่อมไร้ท่อ (ตามที่กล่าวไว้ข้างต้น), ภูมิคุ้มกันวิทยาระดับโมเลกุล, การห้ามเลือด, เมแทบอลิซึมของแร่ธาตุและวิตามิน และสุดท้ายคือน้ำ อิเล็กโทรไลต์และความสมดุลของกรดเบส ในตอนท้ายมีภาคผนวกจำนวนหนึ่งรวมถึงส่วนสูงและน้ำหนักและค่าเผื่อรายวันที่แนะนำ (สหรัฐอเมริกาแน่นอน) เอนไซม์ที่มีความสำคัญทางคลินิกอิเล็กโตรโฟรีซิสของโปรตีนในซีรัมฮีโมโกลบินคำย่อและพารามิเตอร์ทางห้องปฏิบัติการทางคลินิก แต่ละบทได้รับการคัดเลือกมาเป็นอย่างดีและเป็นปัจจุบัน แต่ค่อนข้างสั้น รายการการอ่านเพิ่มเติม ดังนั้นในช่วงต้นของหน้า 33 เราพบเส้นโลหิตตีบด้านข้าง amyotrophic, ไนตริกออกไซด์และภาวะช็อก ฉันจะบอกว่านักเรียนจะหาสิ่งที่ต้องการได้ง่าย และนักเรียนหลายคนชอบวิธีการแบบเดิมๆ โดยส่วนใหญ่ถ้าไม่ครอบคลุมหัวข้อทั้งหมด เราจะเข้าถึงความเกี่ยวข้องทางการแพทย์อย่างรวดเร็ว และการอ่านเพิ่มเติมช่วยให้เข้าถึงบทความที่เกี่ยวข้องได้อย่างรวดเร็ว แต่เห็นได้ชัดว่าผู้เขียน/บรรณาธิการมีปัญหากับสิ่งที่ควรละไว้ ภายใต้โปรตีน มีเนื้อหาที่ทันสมัยมากเกี่ยวกับโรคซิสติกไฟโบรซิส โรค Creutzfeldt-Jakob และโรคอัลไซเมอร์ เป็นต้น แต่แล้วสิ่งพื้นฐานเกี่ยวกับโครงสร้างโปรตีนยังคงบอกเราเกี่ยวกับรีเอเจนต์ของแซงเจอร์ (1-fluoro-2,4- dinitrobenzene) ซึ่งไม่ได้ใช้งานมาเป็นเวลา 25 ปีแล้ว

ต่อไปนี้คือความคิดเห็นบางประการเกี่ยวกับวิธีการจัดการกับบางรายการ บทเกี่ยวกับออกซิเดชันฟอสโฟรีเลชันค่อนข้างจะแตกต่างเกี่ยวกับว่าตอนนี้ทุกคนยอมรับสมมติฐานของมิตเชลล์หรือไม่ มีความครอบคลุมของโรคไมโตคอนเดรียที่ดีและทันสมัย ​​แต่ในความคิดของฉันเกี่ยวกับ cytochrome P น้อยเกินไป450 เอนไซม์และการล้างพิษ มีข้อมูลค่อนข้างมากเกี่ยวกับ P450 เอนไซม์ที่ซ่อนอยู่ในบทสเตียรอยด์ซึ่งอาจสะท้อนถึงการขาดการบูรณาการระหว่างนักเขียนหลายคนอีกครั้ง ตรงกันข้ามกับสิ่งที่กล่าวไว้ ข้อบกพร่องในกลุ่มอาการมาร์แฟนเป็นที่รู้จักกัน (อยู่ในไฟบริลลิน) ตามปกติในตำราชีวเคมีทางการแพทย์ อาจมีโรคจากการสะสมไกลโคเจนมากเกินไป ซึ่งนักศึกษาแพทย์จะไม่มีวันพบเจอ แต่หัวข้อเกี่ยวกับการขาด G6PDH นั้นดี เช่นเดียวกับส่วนเกี่ยวกับฮีโมโกลบินและฮีโมโกลบินผิดปกติ ในทำนองเดียวกัน หัวข้อเกี่ยวกับโรคเบาหวานนั้นดีและเป็นปัจจุบันอย่างเหมาะสม โดยเฉพาะในประเภท II และโรคอ้วน ความครอบคลุมของโครงการ Human Genome นั้นค่อนข้างน่าสงสัย จำนวนยีนคิดเป็น 50–100,000 ยีน และให้ความรู้สึกว่า HUGO ทั้งหมดได้รับการสนับสนุนจาก “กองทุนของรัฐบาลกลาง” ซึ่งอาจทำให้เด็กในเคมบริดจ์ (อังกฤษ) ขุ่นเคืองใจและในที่อื่นๆ ที่มีส่วนสำคัญ ดูเหมือนว่าจะไม่มีการกล่าวถึงเว็บไซต์ แน่นอนว่าสิ่งเหล่านี้เป็นเพียงชั่วคราว แต่ยังมีสิ่งดีๆ อยู่มากมาย ตัวอย่างเช่น เมื่อกล่าวว่ามีไซโตไคน์จำนวนมาก นักเรียนอาจถูกชี้ไปในทิศทางของ www.copingwithcytokines.de เพื่อยกตัวอย่างเพียงหนึ่งตัวอย่าง

โดยรวมแล้วข้อความมีรูปแบบที่ผสมผสานกัน แม้ว่าบทต่างๆ จะถูกเขียนโดยผู้เขียนหลายคน แต่ก็มีข้อยกเว้นบางประการ ดังนั้นบทเกี่ยวกับภูมิคุ้มกันวิทยาระดับโมเลกุลและการห้ามเลือดจึงมีขอบมืดทางการแพทย์ที่น่าสงสัยหรือปัญหาของเคสซึ่งน่าสนใจ แต่รูปแบบไม่เหมาะกับส่วนที่เหลือของหนังสือ บทเหล่านี้เขียนได้ค่อนข้างดี แม้ว่าจะมีใครชื่นชมว่ามันแสดงถึงความท้าทายอย่างมากในการจัดการกับประเด็นสำคัญทางการแพทย์เหล่านี้ในพื้นที่ที่ค่อนข้างเล็ก ในบางบท รวมทั้งสิ่งเหล่านี้ มีแนวโน้มที่จะให้ข้อมูลทั้งหมดในตาราง (โดยปกติคือขนาดใหญ่) (เช่น ส่วนประกอบทั้งหมดของระบบภูมิคุ้มกันและส่วนประกอบทั้งหมดของระบบเสริม) วิธีนี้ใช้ได้ และแน่นอนว่านักเรียนหลายคนอาจพบว่าวิธีนี้มีประโยชน์ในการเก็บรวบรวมข้อมูลไว้ด้วยกันเพื่อการท่องจำ แต่บางครั้งมันก็หนักหน่วงเล็กน้อยและไม่ได้รองรับความคิดเห็นที่เป็นข้อความอย่างเต็มที่เสมอไป

โดยรวมแล้วฉันรู้สึกว่านี่เป็นข้อความที่น่าสนใจสำหรับนักศึกษาแพทย์ ประกอบด้วยชีวเคมีพื้นฐานจำนวนมาก แต่โดยส่วนใหญ่แล้วสิ่งนี้มีความเกี่ยวข้องโดยการอ้างอิงถึงโรคและการวินิจฉัยที่เหมาะสม มันไม่ได้บูรณาการอย่างสมบูรณ์ทั้งในแง่ของเนื้อหาหรือการนำเสนอ แต่สิ่งนี้อาจมีความสำคัญน้อยกว่าสำหรับนักเรียน เนื่องจากพวกเขาจะสามารถค้นหาสิ่งที่ต้องการได้อย่างง่ายดาย (สำหรับการอ้างอิงหรือเพื่อทบทวนการสอบ) โดยมีความเกี่ยวข้องทางการแพทย์มากที่สุด ชีวเคมีถูกครอบคลุม


ผลลัพธ์

การวิเคราะห์ลักษณะของส่วนผสมครอก

คะแนนสูงของ CWM1 (แกน PCA แรก รูปที่ 1a) ส่วนใหญ่ถูกกำหนดโดยความเข้มข้นของ N และ Mg ต่ำ แต่ความเข้มข้นของลิกนินและโพลีฟีนอลสูง C : N และอัตราส่วนลิกนิน : N ส่วนผสมครอกทั้งสอง Alnus + Fraxinus (ด้าน N และ Mg-rich) และ พิสตาเซีย + Quercus (ที่ปลายลิกนินและโพลิฟีนอลสูง) เป็นสองขั้วสุดขั้วตาม CWM1 CWM2 เกี่ยวข้องกับความเข้มข้นของ P และ Ca สูง (ด้วยคะแนนสูงสุดสำหรับ Fraxinus + พิสตาเซีย ของผสม) ตรงข้ามกับความเข้มข้นของเซลลูโลสสูง (ด้วยคะแนนต่ำสุดสำหรับ Alnus + Quercus ส่วนผสม) Rao1 (แกน PCA แรก รูปที่ 1b) แยกของผสมครอกตามความเข้มข้นของ N ที่ไม่เหมือนกันที่เพิ่มขึ้น ตลอดจนอัตราส่วนลิกนิน : N และ C : N ระหว่างสปีชีส์ภายในของผสม (เช่น Alnus + พิสตาเซีย). Rao2 ส่วนใหญ่ถูกกำหนดหาโดยการเพิ่มความแตกต่างในความเข้มข้นของลิกนินไปสู่คะแนนที่สูง (เช่น Alnus + Fraxinus + Quercus) และการเพิ่มความต่างของความเข้มข้นโพลีฟีนอลที่มีต่อคะแนนต่ำ (เช่น Fraxinus + พิสตาเซีย).

ความแตกต่างเฉพาะไซต์ในสภาวะแวดล้อมและชุมชนผู้ย่อยสลาย

ความแปรปรวนในสภาวะแวดล้อม (อุณหภูมิดินและความชื้นสัมพัทธ์ และพารามิเตอร์ของดิน) ระหว่างไซต์งาน (มาตราส่วนภูมิภาค) มีขนาดใหญ่กว่าความแปรผันภายในไซต์ (มาตราส่วนท้องถิ่น) เนื่องจากบล็อกภายในไซต์มักรวมกลุ่มกัน (รูปที่ 2) แกน PCA แรก (Env1) ถูกกำหนดโดยการเพิ่มอุณหภูมิของดิน Olsen P และ pH เป็นหลัก แต่ลดปริมาณทรายลง แกน PCA ที่สอง (Env2) ถูกกำหนดโดยการเพิ่มอัตราส่วน C : N ของดิน แต่ลด NH4 + ความพร้อมใช้งาน ความอุดมสมบูรณ์ของไส้เดือนฝอยทั้งหมดแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญระหว่างไซต์ต่างๆ ตั้งแต่ 65·9 ถึง 3·1 ไส้เดือนฝอยกรัม −1 ดิน แต่ความหลากหลายในการใช้งานของชุมชนไส้เดือนฝอยมีความคล้ายคลึงกัน (รูปที่ S3) ในขณะที่ชีวมวลของจุลินทรีย์ที่ใช้งานอยู่ไม่แตกต่างกันในแต่ละไซต์ (ค่าเฉลี่ยโดยรวมของ 5·5 ไมโครกรัมCO2-C ก. -1 ดิน ชั่วโมง −1 ) ความหลากหลายของฟังก์ชันจุลินทรีย์แตกต่างกันมาก (รูปที่ S4) ขนาดผลกระทบของการมีอยู่ของแมโครต่อการสูญเสียมวลครอกแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญระหว่างไซต์ต่างๆ แต่มีความคล้ายคลึงกันระหว่างสองส่วนผสมครอกที่ประเมิน (รูปที่ S5)

การสูญเสียครอก C และการตรึง N

เมื่อวิเคราะห์ข้อมูลของเราในรูปแบบแฟกทอเรียล เราระบุเอกลักษณ์ของส่วนผสมครอกเป็นปัจจัยหลักที่ส่งผลต่อการสูญเสียครอก C และ N (NS9,180 = 89·68 และ 217·03 ตามลำดับ NS < 0·001 ทั้งสองกรณี รูปที่ 3). แม้ว่าจะพบอัตลักษณ์ของส่วนผสมครอกที่มีนัยสำคัญ × ปฏิสัมพันธ์ของไซต์ (การสูญเสีย C: NS81,180 = 2·31, NS < 0·001 การสูญเสีย: NS81,180 = 1·74, NS = 0·001), Alnus + Fraxinus และ พิสตาเซีย + Quercus แสดงให้เห็นการสูญเสียสูงสุดและต่ำสุดขององค์ประกอบหลักทั้งสองนี้ ตามลำดับ ในทุกไซต์ (รูปที่ S6 และ S7) การสูญเสียครอก N มีความสัมพันธ์อย่างมากกับมวลครอกที่เหลืออยู่ เนื่องจากการถดถอยพหุนามด้วยการปรับกำลังสองอธิบาย 87% ของความแปรปรวนในการสูญเสียครอก N ของครอกผสมและไซต์ต่างๆ (รูปที่ 4) ความสัมพันธ์นี้แสดงให้เห็นว่าในช่วงเริ่มต้นของกระบวนการย่อยสลาย (มากถึง 40% ของการสูญเสียมวลเริ่มต้น) N ถูกตรึง นั่นคือมีจำนวนขยะ N เพิ่มขึ้นสุทธิและทำให้สูญเสีย N ครอกเชิงลบ เกินขีดจำกัดนี้ การปล่อย net N เริ่มต้นในขั้นตอนต่อมาของกระบวนการสลายตัว รูปแบบของการตรึง N และการปล่อยยังขึ้นอยู่กับความเข้มข้น N เริ่มต้นของของผสมครอก เนื่องจาก N การตรึงส่วนใหญ่เกิดขึ้นในสารผสมที่มีความเข้มข้น N เริ่มต้นต่ำกว่า (พิสตาเซีย + Quercus และ Fraxinus + พิสตาเซีย + Quercus).

ตัวขับเคลื่อนภูมิภาคของการสูญเสียครอก C และ N ระหว่างการสลายตัว

ความหลากหลายของลักษณะของครอกมีอิทธิพลมากที่สุดต่อการสูญเสียครอก C และ N ในแบบจำลองสมการเชิงโครงสร้าง (รูปที่ 5) โดยที่ลักษณะทั้งสองของ CWM และความแตกต่างของลักษณะ (Rao's Q) มีบทบาทสำคัญ ในแบบจำลองครอก C ผลกระทบด้านลบของ CWM1 (NS = −0·61, รูปที่ 5a) ระบุการสูญเสียครอก C ที่สูงขึ้นด้วยความเข้มข้นของครอก N และ Mg ที่สูงขึ้น แต่อัตราส่วน C : N และลิกนิน : N ที่ต่ำกว่า Rao1 และ Rao2 มีขนาดเล็กกว่ามาก แม้ว่าผลกระทบอย่างมีนัยสำคัญต่อการสูญเสียครอก C แบบจำลองครอก N เผยให้เห็นความสัมพันธ์ที่คล้ายคลึงและแข็งแกร่งยิ่งขึ้นกับ CWM1 (NS = −0·70) เมื่อเปรียบเทียบกับการสูญเสียครอก C (รูปที่ 5b) อย่างน่าทึ่งการสูญเสียครอก N ได้รับผลกระทบจากลักษณะที่ไม่เหมือนกัน (Rao1 และ Rao2) มากกว่าการสูญเสีย C โดยเฉพาะอย่างยิ่ง Rao2 มีผลในเชิงบวกอย่างเห็นได้ชัดต่อการสูญเสียครอก N (NS = 0·48) แสดงว่าการสูญเสีย N เพิ่มขึ้นเมื่อความต่างของส่วนผสมภายในเพิ่มขึ้นในลิกนิน, N, ลิกนิน : N และ C : อัตราส่วน N แต่ความต่างของความเข้มข้นโพลีฟีนอลลดลง บทบาทของ CWM2 เป็นสัปดาห์มากในทั้งสองรุ่น

สภาวะแวดล้อมเฉพาะพื้นที่ซึ่งพิจารณาถึงความผันแปรของจุลภาคและฟิสิกส์เคมีของดิน (Env1 และ Env2) มีผลกระทบโดยรวมน้อยกว่ามากต่อการสูญเสีย C และ N เมื่อเทียบกับกลไกการทิ้งขยะหลากหลาย (รูปที่ 5) ในทางตรงกันข้าม Env1 และ Env2 มีผลกระทบอย่างชัดเจนและรุนแรงต่อไส้เดือนฝอย (ความอุดมสมบูรณ์และความหลากหลายในการใช้งาน) และจุลินทรีย์ (ชีวมวลและความหลากหลายในการใช้งาน) อย่างไรก็ตาม อิทธิพลนี้ไม่ได้แปลเป็นผลกระทบที่รุนแรงในทำนองเดียวกันของสิ่งมีชีวิตในดินทั้งสองกลุ่มนี้ต่อการสูญเสียครอก C และ N ดังนั้น ผลกระทบทางอ้อมของสภาวะแวดล้อมที่เป็นตัวกลางในการย่อยสลายของดินจึงมีขนาดใกล้เคียงกันเมื่อเปรียบเทียบกับผลกระทบโดยตรง (รูปที่ S8) อย่างไรก็ตาม ที่น่าสนใจ ผลกระทบของจุลินทรีย์ในดินต่อการสูญเสียครอก C นั้นเป็นไปในทางบวก ในขณะที่มันเป็นลบสำหรับการสูญเสียครอก N ในขณะที่ไส้เดือนฝอยมีผลกระทบโดยตรงอย่างมากต่อจุลินทรีย์ในดิน การมีส่วนร่วมของพวกมันในการสลายตัวของเศษซากพืชมีน้อย ตามที่ระบุโดยผลกระทบทางอ้อมต่ำของพวกมันต่อการสูญเสีย C และ N (รูปที่ S8) ขนาดผลกระทบของ macrofauna ต่อการสูญเสียมวลครอก (สัตว์ในกลุ่ม lnRR) เป็นตัวขับเคลื่อนที่สำคัญที่สุดของการสูญเสียครอก C และ N หลังจาก CWM และ Rao's Q โดย macrofauna ส่งเสริมการสูญเสียครอก C และ N ที่สูงขึ้น (NS = 0·32 และ 0·34)


วิทยาศาสตร์การแพทย์: เมื่อไร อย่างไร และอย่างไร

27 กุมภาพันธ์ 2557: บทนี้ได้รับการประเมินใหม่และยังคงเป็นปัจจุบัน ไม่จำเป็นต้องมีการเปลี่ยนแปลงใดๆ

พิมพ์จาก OXFORD MEDICINE ONLINE (www.oxfordmedicine.com) © Oxford University Press, 2021. สงวนลิขสิทธิ์. ภายใต้เงื่อนไขของข้อตกลงใบอนุญาต ผู้ใช้แต่ละรายสามารถพิมพ์ PDF ของชื่อตอนเดียวใน Oxford Medicine Online เพื่อการใช้งานส่วนตัว (สำหรับรายละเอียด โปรดดูที่นโยบายความเป็นส่วนตัวและประกาศทางกฎหมาย)

วิทยาศาสตร์เป็นส่วนหนึ่งของการแพทย์ตะวันตกมาโดยตลอด แม้ว่าสิ่งที่ถือเป็นวิทยาศาสตร์จะเปลี่ยนไปตลอดหลายศตวรรษที่ผ่านมา เช่นเดียวกับเนื้อหาความรู้ทางการแพทย์ เครื่องมือในการตรวจสอบทางการแพทย์ และรายละเอียดของการรักษาพยาบาล ภาพรวมโดยย่อนี้พัฒนาประเภทประวัติศาสตร์ของยาตั้งแต่สมัยโบราณ โดยแบ่ง 'ชนิด' ของยาออกเป็น 5 ประเภท ได้แก่ ข้างเตียง ห้องสมุด โรงพยาบาล สังคม และห้องปฏิบัติการ หมวดหมู่เหล่านี้ยังคงเป็นหัวข้อหลักในงบประมาณด้านสุขภาพสมัยใหม่ แต่ก็มีความสะท้อนทางประวัติศาสตร์ที่เฉพาะเจาะจงด้วย (1) ยาข้างเตียงซึ่งพัฒนาโดยแพทย์ชาวฮิปโปเครติคในสมัยคลาสสิก เป็นยาที่ทันสมัยควบคู่ไปกับการรักษาเบื้องต้น (2) เวชศาสตร์ห้องสมุดที่เกี่ยวข้องกับความคิดเชิงวิชาการของยุคกลาง ยังคงอยู่ในปัญหาการจัดเก็บและค้นข้อมูลในยุคคอมพิวเตอร์ (3) การแพทย์ในโรงพยาบาลซึ่งเป็นศูนย์กลางของการแพทย์ฝรั่งเศสในต้นศตวรรษที่ 19 ได้วางหน้าที่การวินิจฉัยและการรักษาของเวทีศูนย์กลางของโรงพยาบาลสมัยใหม่ไว้ในการดูแลและการสอน (4) เวชศาสตร์สังคมเป็นเรื่องเกี่ยวกับการป้องกันทั้งในระดับชุมชนและส่วนบุคคล โดยเฉพาะอย่างยิ่งในแนวคิดเรื่อง 'ไลฟ์สไตล์' และผลกระทบต่อสุขภาพของเรา (5) เวชภัณฑ์ในห้องปฏิบัติการมีถิ่นกำเนิดตามธรรมชาติในสถาบันวิจัยและเป็นแหล่งสำคัญในการสร้างองค์ความรู้ทางการแพทย์ กำหนดมาตรฐานทั้งด้านวิทยาศาสตร์การแพทย์และเวชศาสตร์วิทยาศาสตร์ François Magendie (1773-1855) อาจเป็นนักวิทยาศาสตร์การแพทย์ที่ 'ทันสมัย' อย่างแท้จริงคนแรก: เขามีความรู้สึกเพียงเล็กน้อยเกี่ยวกับประเพณีทางการแพทย์แทน เขาพยายามที่จะสร้างยาบนพื้นฐานทางวิทยาศาสตร์ใหม่ ๆ

การเข้าถึงเนื้อหาทั้งหมดใน Oxford Medicine Online ต้องสมัครสมาชิกหรือซื้อ ผู้ใช้ทั่วไปสามารถค้นหาไซต์และดูบทคัดย่อสำหรับหนังสือและบทแต่ละเล่มโดยไม่ต้องสมัครสมาชิก

กรุณาสมัครสมาชิกหรือเข้าสู่ระบบเพื่อเข้าถึงเนื้อหาข้อความแบบเต็ม

หากคุณซื้อชื่อสิ่งพิมพ์ที่มีโทเค็นการเข้าถึง โปรดดูข้อมูลเกี่ยวกับวิธีการลงทะเบียนรหัสของคุณที่โทเค็น

สำหรับคำถามเกี่ยวกับการเข้าถึงหรือการแก้ไขปัญหา โปรดตรวจสอบคำถามที่พบบ่อยของเรา และหากคุณไม่พบคำตอบที่นั่น โปรดติดต่อเรา


พิสูจน์ว่าสาย Sorgenfrey ถูกตัดการเชื่อมต่อโดยสิ้นเชิง

ให้ $ mathbb_l $ หมายถึงพื้นที่ทอพอโลยีที่มีเซตพื้นฐานคือเส้นจริง $ mathbb $ และโทโพโลยีถูกสร้างขึ้นโดยช่วงครึ่งปิด $ [a,b) $ พิสูจน์ว่าพื้นที่ทอพอโลยี $ mathbb_l $ ถูกตัดการเชื่อมต่อโดยสิ้นเชิง

ช่องว่างจะถูกตัดการเชื่อมต่อโดยสิ้นเชิงหากส่วนประกอบที่เชื่อมต่อเป็นชุดแบบจุดเดียว ให้ชุดใด ๆ $ Iin mathbb_l $, $ I=[a,b) $ สำหรับ $ ale b $ ใน $ R $ ถ้า $ a=b $, $ I $ เป็นเซตหนึ่งจุดและเป็นส่วนประกอบที่เชื่อมต่อกันอย่างชัดเจน (ไม่มี $ A,Bin I $ ทั้งที่ไม่ว่างเปล่าและเหมาะสม) ถ้า $ a<b $, $ I $ ไม่ใช่ชุดแบบจุดเดียวและมี $ c $ ที่มี $ a<c<b $ จากนั้น $ A=[a,c) $ และ $ B=[c,b) $ เป็นเซตย่อยเปิดที่เหมาะสมของ $ I $ และแยกจากกันของ $ I $ เพราะ $ Acap B= ชุดว่าง $ และ $ Acup B=I $ ดังนั้นจึงเป็นที่ชัดเจนว่าส่วนประกอบที่เชื่อมต่อเท่านั้นใน $ mathbb_l $ เป็นเซตแบบจุดเดียว ดังนั้นพื้นที่ทอพอโลยี $ mathbb_l $ ถูกตัดการเชื่อมต่อโดยสิ้นเชิง


เชิงนามธรรม

วัตถุประสงค์

เพื่อตรวจสอบความสัมพันธ์ที่เป็นไปได้ของการเสื่อมสภาพตามอายุ (AMD) ซึ่งเป็นโรคความเสื่อมเรื้อรังที่เกี่ยวข้องกับอายุของเรตินาที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบและการแก่ชรา ที่มีความไวต่อการติดเชื้อ SARS-CoV-2 และผลลัพธ์ของ COVID-19 ที่รุนแรง

ออกแบบ

การศึกษาตามรุ่นทั่วประเทศพร้อมการจับคู่คะแนนความโน้มเอียง

การตั้งค่า

กลุ่มประชากรตามประชากรทั่วประเทศในเกาหลี

ศึกษาประชากร

ข้อมูลได้มาจาก Health Insurance Review & Assessment Service ของเกาหลี รวมถึงผู้ป่วยทุกรายที่มีอายุมากกว่า 40 ปีที่ได้รับการทดสอบ SARS-CoV-2 ในเกาหลีใต้ระหว่างวันที่ 1 มกราคม 2020 ถึง 15 พฤษภาคม 2020 (ไม่รวมการอ้างอิงจากตัวเอง)

มาตรการผลลัพธ์หลัก

ผลบวกของการทดสอบ SARS-CoV-2 เป็นผลลัพธ์หลัก และผลลัพธ์ทางคลินิกที่รุนแรงของ COVID-19 เป็นผลลัพธ์รอง

ผลลัพธ์

กลุ่มที่ไม่ตรงกันประกอบด้วยผู้ป่วย 135,435 รายที่ได้รับการทดสอบสำหรับ SARS-CoV-2 4531 (3.3%) ที่ได้รับการทดสอบในเชิงบวกสำหรับผู้ป่วย SARS-CoV-2 5493 (4.1%) มี AMD หลังจากจับคู่คะแนนความโน้มเอียงแล้ว AMD exudative มีความเกี่ยวข้องกับความเป็นไปได้ที่จะติดเชื้อ SARS-CoV-2 ที่เพิ่มขึ้น (adjusted odds ratio [aOR], 1.50 95% trust ช่วง [CI], 1.03-2.25) และความเสี่ยงมากขึ้นของ ผลลัพธ์ทางคลินิกที่รุนแรงของ COVID-19 (aOR, 2.26 95% CI, 1.02 ถึง 5.26) แต่ไม่ใช่ AMD และ AMD ที่ไม่ก่อให้เกิดการหลั่ง

บทสรุป

ในกลุ่มประชากรในประเทศเกาหลี ข้อมูลของเราแนะนำว่าแพทย์ควรตระหนักถึงความเสี่ยงที่มากขึ้นของความไวต่อผลลัพธ์ทางคลินิกที่รุนแรงของ COVID-19 ในผู้ป่วยที่เป็นโรค AMD การค้นพบของเราช่วยให้เข้าใจความสัมพันธ์ระหว่างการเกิดโรคของ COVID-19 กับความผิดปกติทางระบบประสาทเรื้อรังได้ดีขึ้น


3. สมุนไพรผ่อนคลาย เพื่อปรับปรุงคุณภาพการนอนหลับ

มีสมุนไพรหลายชนิดที่สามารถช่วยปรับปรุงคุณภาพการนอนหลับได้ ฉันพบว่าสำหรับคนที่มีอาการนอนไม่หลับอย่างรุนแรง สมุนไพรเหล่านี้ไม่ได้ผลมากนัก อย่างไรก็ตาม เมื่อใช้ร่วมกับกลยุทธ์อื่นๆ สมุนไพรบางชนิดสามารถช่วยเสริมแผนการนอนได้เป็นอย่างดี

สมุนไพรที่ฉันชอบใช้เพื่อปรับปรุงการนอนหลับ ได้แก่ kava, chamomile, valerian, passionflower, lavender และ lemon balm แทนที่จะออกไปซื้อสมุนไพรเหล่านี้ ฉันมักจะแนะนำชา Nighty Night ที่ผลิตโดยแพทย์แผนโบราณซึ่งรวมสมุนไพรเพื่อการนอนที่ดีที่สุดหลายชนิดไว้ในถุงชาใบเดียว ใช้สิ่งนี้ทุกวันเพื่อปรับปรุงคุณภาพการนอนหลับ! นอกจากนี้เรายังมีผลิตภัณฑ์เสริมอาหารที่ดีเยี่ยมด้วยปริมาณสมุนไพรที่สงบเงียบเหล่านี้ซึ่งเรียกว่า Relax Calm


วัสดุและวิธีการ

การสร้างแบ็คโบนแอสเซมบลี Loop

เวกเตอร์การประกอบลูปถูกสร้างขึ้นโดยใช้การประกอบ Gibson (Gibson et al., 2552 ). มีการเปลี่ยนแปลงหลายอย่างกับเวกเตอร์ pGreenII (Hellens et al., 2000 ) เพื่อให้ได้แกนหลักของพลาสมิดสำหรับเวกเตอร์ประกอบแบบวนซ้ำ: ไซต์ BsaI และ SapI ถูกลบออกจากพลาสมิดโดยใช้การกลายพันธุ์แบบเงียบเมื่อเป็นไปได้ เพื่อลดปัญหาความเสถียรของโครงสร้างขนาดใหญ่ในแบคทีเรีย (Moore et al., 2016 วัตสัน et al., 2016 ) นิวคลีโอไทด์สองนิวคลีโอไทด์ของแหล่งกำเนิดการจำลองแบบ pGreenII ColEI ถูกกลายพันธุ์โดยย้อนกลับเป็นหมายเลขสำเนาปานกลางถึงต่ำ pBR322 ต้นกำเนิดของการจำลองแบบ บริเวณที่ขยายจากเส้นขอบด้านซ้ายของ T-DNA ไปยังตลับเทปยีนต้านทาน hygromycin ถูกแทนที่ด้วยลำดับของเวกเตอร์ pET15 (Haseloff, 1999 ) จากจุดสิ้นสุด nptII nosT ถึง UASGAL4 โปรโมเตอร์ (ฐาน 2851–3527) การดื้อยาสเปกติโนมัยซินถูกโคลนเพื่อแทนที่คาสเซ็ต nptI เพื่อจัดให้มีเครื่องหมายการคัดเลือกจุลินทรีย์สำหรับพลาสมิด pEven UNSs ถูกโคลนเข้าไปในเวอร์ชันกานามัยซินและสเปกติโนมัยซินของกระดูกสันหลังเวกเตอร์หลังจากสิ้นสุด 3′ ของลำดับเวกเตอร์ pET15 และเส้นขอบด้านขวา สุดท้าย ตำแหน่งเอนไซม์จำกัดการวนซ้ำ (BsaI และ SapI) ส่วนยื่นและตลับเทป lacZα ถูกโคลนระหว่าง UNSs โดยให้เวกเตอร์ pOdd และ pEven พลาสมิด L0 ที่ใช้สำหรับการประกอบ Loop Type IIS ถูกประกอบโดยใช้ชุดประกอบ Gibson ให้เป็นพลาสมิด pUDP2 (BBa_P10500) ที่ดัดแปลงแล้ว ซึ่งมีลำดับสุ่ม 20-bp (5′-TAGCCGGTCGAGTGATACACTGAAGTCTC-3′) ปลายทางของไซต์ BsaI ที่บรรจบกัน 3′ และต้นน้ำของ ส่วนต่อท้าย BioBrick เพื่อให้บริเวณขนาบข้างที่ไม่เป็นเนื้อเดียวกันสำหรับการวางแนวที่ถูกต้องระหว่างการประกอบที่ทับซ้อนกัน

สเปเซอร์ดีเอ็นเอ

ดึงลำดับดีเอ็นเอแบบสุ่มจากตัวสร้างลำดับดีเอ็นเอแบบสุ่ม (https://www.faculty.ucr.edu/

mmaduro/random.htm) สั่งเป็นชิ้นส่วน dsDNA จาก IDT และประกอบโดยใช้ชุดประกอบ Gibson

พลาสมิดและการออกแบบโครงสร้าง

ชิ้นส่วน L0 ที่ใช้สำหรับการสร้างดีเอ็นเอได้อธิบายไว้ในตารางข้อมูลสนับสนุน S1 ลำดับของชิ้นส่วนเหล่านี้รวมอยู่ในข้อมูลสนับสนุนและหาได้จาก Addgene ลำดับของพลาสมิดลูปและการรวมมัลติยีนที่เป็นผลลัพธ์จะรวมอยู่ในข้อมูลสนับสนุน

การออกแบบโครงสร้างดำเนินการโดยใช้ซอฟต์แวร์ LoopDesigner ซึ่งติดตั้งบนเครื่องท้องถิ่น ซอฟต์แวร์ได้รับการกำหนดค่าให้ใช้แบ็คโบนแอสเซมบลีของลูปร่วมกับ BsaI และ SapI RE รวมถึงโอเวอร์แฮงก์ A–B และ α–ω นอกจากนี้ ซอฟต์แวร์ยังได้เพิ่มคำจำกัดความของประเภทชิ้นส่วน L0 12 ชนิด โดยอิงตามระยะยื่นที่ระบุโดยไวยากรณ์ทั่วไป เพิ่มลำดับของชิ้นส่วน L0 ลงในฐานข้อมูล LoopDesigner โดยกำหนดประเภทชิ้นส่วนที่กำหนดไว้อย่างใดอย่างหนึ่ง และประกอบเข้าด้วยกันเป็นโครงสร้างระดับ 1 และระดับ 2 ในซิลิโค. ความเข้มข้นของชิ้นส่วน L0 และโครงสร้างระดับ 1 ถูกปรับตามที่แนะนำโดย LoopDesigner สำหรับปฏิกิริยา 10 ไมโครลิตร

โปรโตคอลการประกอบ IIS แบบวนซ้ำ

โปรโตคอลการประกอบ Loop Type IIS ได้รับการดัดแปลงจากผู้มีพระคุณ ( 2016 ) และสามารถดูได้ที่ https://www.protocols.io/view/loop-assembly-pyqdpvw ส่วนย่อยของ 15 fmol ของแต่ละส่วนที่จะประกอบถูกผสมกับ 7.5 fmol ของตัวรับพลาสมิดในปริมาตรสุดท้าย 5 ไมโครลิตรกับ H กลั่น2โอ (dH2O) (ตาราง S2). ส่วนผสมของปฏิกิริยาที่มี dH . 3 ไมโครลิตร2O, 1 ไมโครลิตรของ T4 DNA ligase buffer 10× (หมายเลข B0202 NEB, Ipswich, MA, USA), 0.5 μl 1 mg ml ml −1 เซรั่มอัลบูมินบริสุทธิ์จากวัว (1 : 20 การเจือจางใน dH2O ของ BSA, Molecular Biology Grade 20 mg ml -1 , NEB cat. B9000), 0.25 µl ของ T4 DNA ligase ที่ 400 U µl −1 (NEB cat. M0202) และ 0.25 µl ของเอ็นไซม์จำกัดที่ 10 U µl -1 (BsaI NEB cat. R0535 or SapI NEB cat. R0569) ถูกเตรียม บนน้ำแข็ง. จากนั้น ผสม 5 ไมโครลิตรของปฏิกิริยาผสมกับส่วนผสมดีเอ็นเอ 5 ไมโครลิตรสำหรับปริมาตรปฏิกิริยา 10 ไมโครลิตร (ตาราง S3) โดยการปิเปต และบ่มในเทอร์โมไซเลอร์โดยใช้โปรแกรมที่อธิบายไว้ในตาราง S4 สำหรับปฏิกิริยา SapI บัฟเฟอร์ T4 DNA ligase ถูกแทนที่ด้วย CutSmart buffer (NEB cat. B7204S) ที่เสริมด้วย 1 mM ATP 1 µl ของส่วนผสมของปฏิกิริยาถูกเติมลงในเซลล์ TOP10 ที่มีความสามารถทางเคมี 50 µl (หมายเลข C4040100 ThermoFisher) และหลังจากการฟักตัว ที่ 42°C เป็นเวลา 30 วินาที, ตัวอย่างถูกทิ้งไว้บนน้ำแข็งเป็นเวลา 5 นาที, 250 ไมโครลิตรของน้ำซุป Super Optimal ที่มีตัวกลางในการกดขี่ของ Catabolite (SOC) และเซลล์ถูกบ่มที่ 37°C เป็นเวลา 1 ชั่วโมง สุดท้าย 5 ไมโครลิตรของ 25 มก. มล. -1 ของ 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β- d -galactopyranoside (X-Gal) (หมายเลข B4252 Sigma-Aldrich) ละลายในไดเมทิลซัลฟอกไซด์ (DMSO) คือ เติมและเซลล์ถูกเคลือบลงบนเพลต Lysogeny broth (LB) ที่คัดเลือกมาซึ่งเสริมด้วย Isopropyl β- d -1-thiogalactopyranoside (IPTG) 1 มิลลิโมลาร์ (หมายเลข I6758 Sigma-Aldrich) ปฏิกิริยาการประกอบยังเป็นไปโดยอัตโนมัติ ปฏิกิริยาการประกอบเหมือนกัน แต่ลดขนาดลงเหลือปริมาตรรวม 1 ไมโครลิตร ปฏิกิริยาถูกตั้งค่าบน Labcyte Echo (ซานโฮเซ แคลิฟอร์เนีย สหรัฐอเมริกา) ในเพลต 384 หลุม และฟักไข่บนเครื่องปั่นจักรยานด้วยความร้อนโดยใช้เงื่อนไขเดียวกันกับที่อธิบายไว้ข้างต้น ปฏิกิริยาถูกเปลี่ยนเป็นเซลล์พิเศษ XL10-Gold ® ที่มีความสามารถ 4 ไมโครลิตร (Agilent Technologies, Santa Clara, CA, USA) และชุบบนเพลต LB-agar แบบคัดเลือกแปดหลุม เลือกอาณานิคมสำหรับการเจริญเติบโตในอาหารขนาด 1 มล. ในเพลต 96 หลุมบนแพลตฟอร์ม Hamilton STARplus ® (รีโน รัฐเนวาดา สหรัฐอเมริกา)

PCR มาตรฐานของหน่วยการถอดความ

PCR โดยใช้โอลิโกนิวคลีโอไทด์ของ UNS ดำเนินการที่อุณหภูมิการหลอม 60 องศาเซลเซียส โดย 35 รอบโดยใช้ Phusion High-Fidelity DNA polymerase (หมายเลข F-530 ThermoFisher) ในปฏิกิริยา 50 ไมโครลิตร ตามคำแนะนำของผู้ผลิต แม่แบบถูกเพิ่มไปยังความเข้มข้นสุดท้าย 20 pg μl -1 มองเห็นชิ้นส่วนดีเอ็นเอโดยใช้ SYBR Safe DNA Gel Stain (หมายเลข S33102 ThermoFisher) บนเครื่องทรานสลูมิเนเตอร์ LED สีฟ้า (IORodeo, Pasadena, CA, USA) การทำ DNA ให้บริสุทธิ์โดยใช้ NucleoSpin Gel และ PCR Clean-up purification kit (หมายเลข 740609.250 Macherey-Nagel, Düren, เยอรมนี) ไพรเมอร์ UNS ที่ใช้ในการขยาย TU แสดงอยู่ในตาราง S5

การตรวจสอบโดยการจัดลำดับ

ลำดับของพลาสมิดที่ประกอบเข้าด้วยกันได้รับการตรวจสอบโดยการจัดลำดับโดยสมบูรณ์โดยใช้การอ่านแบบคู่คู่ 150 เบสบนแพลตฟอร์ม Illumina MiSeq และสามารถพบได้ในฐานข้อมูล EMBL-ENA ที่จัดกลุ่มภายใต้การศึกษา PRJEB29863 ห้องสมุดถูกจัดเตรียมโดยใช้ Nextera XT DNA Library Prep Kit (หมายเลข FC-131-1096 Illumina Inc., ซานดิเอโก, แคลิฟอร์เนีย, สหรัฐอเมริกา) โดยใช้โปรโตคอลของผู้ผลิตที่แก้ไขให้เจือจางหนึ่งในสี่ การอ่านถูกกรองและตัดแต่งสำหรับฐานคุณภาพต่ำและจับคู่กับพลาสมิดโดยใช้ 'เครื่องมือแผนที่เพื่ออ้างอิง' จากซอฟต์แวร์ Geneious 8.1.8 (https://www.geneious.com Kearse et al., 2012 ) พร้อมพารามิเตอร์มาตรฐาน ความเที่ยงตรงของลำดับถูกกำหนดด้วยตนเอง

อะโกรแบคทีเรียม-สื่อกลาง Marchantia การเปลี่ยนแปลง

อะโกรแบคทีเรียม- การแปลงแบบเป็นสื่อกลางได้ดำเนินการตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (Ishizaki et al., 2008 ) โดยมีข้อยกเว้นดังต่อไปนี้: มีการใช้สปอร์ที่มีสปอร์ที่มีอาร์เคโกเนียครึ่งหนึ่ง (สปอร์เฮด) ครึ่งหนึ่งในการเปลี่ยนแปลงแต่ละครั้ง หัวสปอร์ที่แห้งแล้วถูกบดในหลอดฟอลคอนขนาด 50 มล. กับท่อฟอลคอนขนาด 15 มล. และแขวนลอยใหม่ในน้ำ 1 มล. ต่อหัวสปอร์ สปอร์ที่ถูกแขวนลอยใหม่ถูกกรองผ่านตาข่ายขนาด 40 ไมโครเมตร (หมายเลข 352340 Corning Inc., NY, USA) และสารแขวนลอย 1 มล. ถูกแบ่งส่วนลงในหลอด Eppendorf ขนาด 1.5 มล. และหมุนเหวี่ยงที่ 13 000 NS เป็นเวลา 1 นาทีที่อุณหภูมิห้อง ส่วนลอยเหนือตะกอนถูกทิ้งและสปอร์ถูกแขวนลอยใหม่ในสารละลายฆ่าเชื้อ 1 มล. และบ่มที่อุณหภูมิห้องเป็นเวลา 20 นาทีที่ 150 รอบต่อนาทีบนเชคเกอร์แบบโคจร The sterilization solution was prepared by dissolving one Milton mini-sterilizing tablet (Milton Pharmaceutical UK, Cheltenham, UK active ingredient, sodium dichloroisocyanurate CAS: 2893-78-9: 19.5% w/w) in 25 ml of sterile water. Samples were centrifuged at 13 000 NS for 1 min, washed once with sterile water and resuspended in 100 μl of sterile water per spore-head used. One hundred microlitres of sterilized spores were inoculated onto half-strength Gamborg's B5 1% (w/v) agar plates and grown under constant fluorescent lighting (50–60 mol photons m −2 s −1 ) upside down for 5 d until co-cultivation. Sporelings were co-cultivated with previously transformed and induced อะโกรแบคทีเรียม GV2260 transformed with the pSoup plasmid (Hellens et al., 2000 ) in 250-ml flasks containing 25 ml of half-strength Gamborg's B5 medium supplemented with 5% (w/v) sucrose, 0.1% (w/v) N-Z Amine A (Sigma cat. C7290), 0.03% (w/v) L-glutamine (Sigma cat. G8540) and 100 μM acetosyringone (Sigma-Aldrich cat. D134406) for 36 h, until washing and plating onto selective medium.

Laser scanning confocal microscopy

A microscope slide was fitted with a 65-μl Gene Frame (ThermoFisher cat. AB0577) and 65 μl of dH2O was placed in the centre. Marchantia gemmae was carefully deposited on the drop of dH2O using a small inoculation loop and a #0 coverslip was attached to the Gene Frame. Slides were examined on a Leica, Wetzlar, Germany TCS SP8 confocal microscope platform equipped with a white-light laser (WLL) device. Imaging was conducted using a Leica HC PL APO 20× CS2 air objective with a sequential scanning mode with laser wavelengths of 405, 488 and 515 nm, capturing emitted fluorescence at 450–482-, 492–512- and 520–550-nm windows, respectively, in each sequential scan. Z-stacks were collected every 5 μm for the complete volume range and maximum intensity projections were processed using Image J software. Fluorescence bleedthrough from the blue pseudocoloured channel (membrane-localized enhanced green fluorescent protein (eGFP)) into the green pseudocoloured channel (nuclear-localized Venus) was eliminated using custom Python scripts which subtracted 20% of the value of pixels present in the blue channel to the green channel. Images were edited to scale the pixel intensity to the full 8-bit range and a merged image was processed.

Transient expression in Arabidopsis mesophyll protoplasts

Well-expanded leaves from 3–4-wk-old Arabidopsis plants (Columbia-0) were used for protoplast transfection. Plants were grown at 22°C in low-light (75 μmol m −2 s −1 ) and short-photoperiod (12 h : 12 h, light : dark) conditions. Protoplasts were isolated and polyethylene glycol (PEG) transfected according to Yoo et al. ( 2007 ). For transfection, 6 μl of Loop L2 plasmids (2 μg μl −1 ), isolated by a NucleoBond Xtra Midi/Maxi purification kit (Macherey-Nagel cat. 740410.50), were used. Transfected protoplasts were incubated for 12 h in light and then visualized by epifluorescent microscopy in a Neubauer chamber (Hirschmann Laborgeräte, Eberstadt, Germany).

Epifluorescence microscopy

Transfected protoplasts were visualized using a Nikon Ni microscope (Minato, Tokyo, Japan) equipped with 49021 ET – EBFP2/Coumarin/Attenuated DAPI (excitation, 405/20 nm dichroic, 425 nm emission, 460/50 nm), 96227 AT-EYFP (excitation, 495/20 nm dichroic, 515 nm emission, 540/30 nm), 96223 AT-ECFP/C (excitation, 495/20 nm dichroic, 515 nm emission, 540/30 nm) and 96312 G-2E/C (excitation, 540/20 nm dichroic, 565 nm emission, 620/60 nm) filter cubes.

LoopDesigner

In order to implement an object-oriented model for Loop assembly, we built a PartsDB library (https://github.com/HaseloffLab/PartsDB) to define several interlinked classes, each of which is associated with a table in a relational SQL database. The structure of LoopDesigner is built around a ส่วนหนึ่ง class, which either represents an ordered collection of children parts from which it is assembled, or a DNA sequence in the case of L0 parts. In this way, we ensured that the actual DNA sequence is only stored once, and the sequences of L1 and higher parts are constructed on demand from the relational links. In addition, each ส่วนหนึ่ง is associated with one of the กระดูกสันหลัง instances which, together with a ส่วนหนึ่ง sequence, represents a complete Loop assembly plasmid. Every instance of a กระดูกสันหลัง class is a combination of a ลำดับฐาน and a donor Restriction Enzyme Site, for example, pOdd 1-4 and pEven 1-4 are กระดูกสันหลัง instances in the schema described in this article. ลำดับฐาน represents a type of receiver plasmid, for example, pOdd and pEven, and is composed of a DNA sequence of the plasmid and an instance of a receiver Restriction Enzyme Site. ในที่สุด, Restriction Enzyme Site class is composed of a Restriction Enzyme instance, which stores the restriction enzyme recognition sequence, and a pair of overhang sequences, which can be either receiver or donor overhangs.


เปิดการวิจัย

Age measurements from the plasma proteomic dataset derived from 4263 individuals (aged 18–95 years) are accessible via an online software tool (https://twc-stanford.shinyapps.io/aging_plasma_proteome/). The full plasma proteomic dataset derived from 3301 individuals (aged 18–76 years) is available in the European Genotype Archive (accession number EGAS00001002555).

ชื่อไฟล์ คำอธิบาย
acel13256-sup-0001-FigS1.TIFTIFF image, 3.6 MB
acel13256-sup-0002-FigS2.TIFTIFF image, 2.9 MB
acel13256-sup-0003-FigS3.TIFTIFF image, 656.8 KB
acel13256-sup-0004-FigS4.TIFTIFF image, 669.5 KB
acel13256-sup-0005-FigS5.TIFTIFF image, 722.4 KB
acel13256-sup-0006-FigS6.TIFTIFF image, 647.8 KB
acel13256-sup-0007-FigS7.TIFTIFF image, 2.1 MB Fig S7
acel13256-sup-0008-FigS8.TIFTIFF image, 727.4 KB
acel13256-sup-0009-FigS9.TIFTIFF image, 910.1 KB
acel13256-sup-0010-FigS10.TIFTIFF image, 1.9 MB
acel13256-sup-0011-TableS1-S11.xlsxapplication/excel, 1.3 MB
acel13256-sup-0012-Legends.docxWord document, 15.8 KB

โปรดทราบ: ผู้จัดพิมพ์จะไม่รับผิดชอบต่อเนื้อหาหรือการทำงานของข้อมูลสนับสนุนใด ๆ ที่จัดทำโดยผู้เขียน คำถามใด ๆ (นอกเหนือจากเนื้อหาที่ขาดหายไป) ควรส่งไปยังผู้เขียนที่เกี่ยวข้องสำหรับบทความ


ดูวิดีโอ: นยาย ระบบปรศนา MPE: Ep 21-25 (สิงหาคม 2022).