ข้อมูล

D1. กลไกการเรียงลำดับพื้นผิวหลายชั้น - ชีววิทยา

D1. กลไกการเรียงลำดับพื้นผิวหลายชั้น - ชีววิทยา


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

ในความเป็นจริง เอนไซม์จำนวนมากมีสารตั้งต้นมากกว่าหนึ่งชนิด (A, B) และผลิตภัณฑ์มากกว่าหนึ่งชนิด (P, Q) สิ่งนี้จะให้ชุดของพล็อตเชิงเส้น 1/v เทียบกับ 1/A สองส่วนกลับ (แปลง Lineweaver-Burk) เช่นกัน รูปแบบของแผนภาพ Lineweaver-Burk ขึ้นอยู่กับว่าสารตั้งต้นและผลิตภัณฑ์มีปฏิสัมพันธ์กับเอนไซม์อย่างไร

กลไกการเรียงลำดับ

ในกลไกนี้ ซับสเตรตทั้งสองจะต้องจับกับเอ็นไซม์ก่อนที่จะผลิตและปล่อยผลิตภัณฑ์ใดๆ ซับสเตรตอาจจับกับเอ็นไซม์ในลักษณะสุ่ม (A ก่อนแล้ว B หรือในทางกลับกัน) หรือตามลำดับ (A ก่อนตามด้วย B) โครงการสัญกรณ์ย่อที่พัฒนาโดย W.W. Cleland แสดงไว้ด้านล่างสำหรับกลไกการเรียงลำดับแบบสุ่มและแบบต่อเนื่องตามลำดับ สำหรับกลไกทั้งสอง Lineweaver-Burk จะแปลงค่า A ที่แตกต่างกันและค่าคงที่ที่แตกต่างกันของ B ให้ชุดของเส้นตัดกัน เส้นกราฟอนุพันธ์สามารถแก้ไขได้เพื่อให้ได้ค่าคงที่จลนศาสตร์ที่เหมาะสม


การสูญเสีย D1 ที่โตเต็มที่จะทำให้การประกอบ CP43 เสียหายใน Arabidopsis thaliana

Photosystem II (PSII) เป็นคอมเพล็กซ์โปรตีนเม็ดสี โปรตีน เม็ดสี ลิพิด และไอออนใน PSII จำเป็นต้องประกอบเข้าด้วยกันอย่างแม่นยำเพื่อให้แน่ใจว่ามีการสร้าง PSII biogenesis ที่เหมาะสม D1 เป็นหน่วยย่อยหลักของศูนย์ปฏิกิริยาแกนหลักของ PSII (RC) และมักถูกสังเคราะห์เป็นสารตั้งต้น D1 การสุกของ D1 โดยโปรตีเอสโปรตีเอส CtpA สำหรับการประมวลผล C-terminal เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการประกอบ PSII อย่างไรก็ตาม กลไกที่มีรายละเอียดเกี่ยวกับวิธีการเจริญเติบโตเต็มที่ของ D1 ส่งผลต่อการประกอบ PSII นั้นยังไม่กระจ่างชัดจนถึงตอนนี้ ในการศึกษาครั้งนี้ Arabidopsis thaliana CtpA กลายพันธุ์ (atctpa: SALK_056011)ซึ่งไม่มีกระบวนการครบกำหนดของ D1 ถูกนำมาใช้เพื่อตรวจสอบการทำงานของกระบวนการนี้ในการประกอบ PSII ในรายละเอียดเพิ่มเติม

ผลลัพธ์

หากไม่มีการประมวลผลที่ปลาย C ของสารตั้งต้น D1 การประกอบ PSII ซึ่งรวมถึงโมโนเมอร์ PSII, ไดเมอร์ โดยเฉพาะอย่างยิ่ง PSII supercomplexes (PSII SCs) ส่วนใหญ่ถูกทำลายดังที่รายงานไว้ก่อนหน้านี้ Western blotting ตามหน้า BN-2D-SDS เปิดเผยว่าแม้ว่าการประกอบ PSII core protein D2, CP43 และ CP47 จะได้รับผลกระทบจากการสูญเสียกระบวนการ D1 ที่เจริญเต็มที่ แต่การรวม CP43 ได้รับผลกระทบมากที่สุด โดยบ่งชี้ว่าประสิทธิภาพการประกอบที่ลดลงมากที่สุด ลงใน PSII SCs นอกจากนี้ การเติบโตของเซลล์ยีสต์ที่ช้าลงซึ่งถูกเปลี่ยนรูปแบบร่วมกันด้วย pD1 และ CP43 เมื่อเปรียบเทียบกับเซลล์ยีสต์ที่เปลี่ยนรูปร่วมกับ D1 และ CP43 ที่โตเต็มที่ รับรองการมีอยู่ของปลาย D1 C-terminal ขัดขวางประสิทธิภาพการทำงานร่วมกันระหว่าง D1 และ CP43 แสดงให้เห็นถึงความสำคัญทางสรีรวิทยาของกระบวนการเจริญเต็มที่ของ D1 ต่อการประกอบ PSII และการเจริญเติบโตของสิ่งมีชีวิต

บทสรุป

น็อคเอาท์ Arabidopsis atctpa การกลายพันธุ์เป็นวัสดุที่ดีในการศึกษาความเชื่อมโยงที่ไม่คาดคิดระหว่างการสุกของ D1 และการประกอบ PSII SCs การสูญเสียการสุกของ D1 ส่วนใหญ่ส่งผลกระทบต่อการรวมตัวของโปรตีนแกน PSII CP43 ซึ่งเป็นโปรตีนที่จับกับเสาอากาศภายใน ซึ่งทำหน้าที่ในการเชื่อมโยงของคอมเพล็กซ์ LHCII กับ PSII dimers ระหว่างการก่อตัวของ PSII SCs การค้นพบของเราในที่นี้ให้การสนับสนุนโดยละเอียดเกี่ยวกับบทบาทของการเจริญเติบโตของ D1 ระหว่างการประกอบ PSII SCs ในโรงงานที่สูงขึ้น


ความผิดปกติของต่อมไทรอยด์ในวัยเด็กและวัยรุ่น

DELBERT A. FISHER MD , ANNETTE GRUETERS MD , ในกุมารเวชศาสตร์ต่อมไร้ท่อ (ฉบับที่สาม) , 2008

การเผาผลาญของฮอร์โมนไทรอยด์

การกำจัดไอโอดีนเป็นเส้นทางหลักของการเผาผลาญฮอร์โมนไทรอยด์ 13 ขั้นตอนแรกในการเผาผลาญของ T4 คือการขจัดไอโอดีนไปที่ T3 หรือเพื่อย้อนกลับ T3 (rT3) ( รูปที่ 7-1 ) การกำจัดไอโอดีนแบบโปรเกรสซีฟของไอโอโดไทโรนีนเป็นสื่อกลางผ่านเอ็นไซม์ monodeiodinase สามตัว: MDI type I, MDI type II และ MDI type III (ตารางที่ 7-2) โมโนไดไอโอดีนของเบต้าหรือวงแหวนรอบนอก (เทียบกับสายโซ่ด้านอะลานีน) ทำให้เกิด T3 ซึ่งมีศักยภาพในการเผาผลาญของ T4 สามถึงสี่เท่า monodeiodination ของ alpha หรือ inner-ring สร้าง rT3 ซึ่งส่วนใหญ่ไม่ได้ใช้งานเมตาบอลิซึม ภายใต้สถานการณ์ปกติ T3 และ rT3 ถูกผลิตขึ้นในอัตราใกล้เคียงกัน

ในเนื้อเยื่อส่วนใหญ่ (โดยเฉพาะตับ ยกเว้นสมองและเนื้อเยื่อไขมันสีน้ำตาล) T3 และ rT3 (สร้างโดย T4 monodeiodination) จะแพร่กระจายอย่างรวดเร็วจากเนื้อเยื่อไปยังของเหลวคั่นระหว่างหน้าไปยังพลาสมา ปริมาณ T3 ที่มีนัยสำคัญและ rT3 จำนวนเล็กน้อยจะถูกสังเคราะห์และปล่อยออกมาจากต่อมไทรอยด์ ดังนั้น ระดับการหมุนเวียนของ T3 และ rT3 จึงสะท้อนถึงทั้งการหลั่งและการผลิตส่วนปลาย จาก 70% ถึง 90% ของ T3 หมุนเวียนนั้นมาจากการแปลงอุปกรณ์ต่อพ่วงและ 10% ถึง 25% จากต่อมไทรอยด์ ค่าที่เกี่ยวข้องสำหรับ rT3 คือ 96% ถึง 98% และ 2% ถึง 4% ปฏิกิริยา monodeiodination ของเนื้อเยื่อที่ก้าวหน้าจะลด T3 และ rT3 เป็น diiodo, monoiodo และ noniodinated thyronine

สายด้านข้างที่เป็นอะลานีนของวงแหวนด้านในของไอโอโดไทโรนีนยังอยู่ภายใต้ปฏิกิริยาการย่อยสลาย รวมถึงการทรานส์มิเนชัน การดีอะมิเนชัน และดีคาร์บอกซิเลชัน 14 ความคล้ายคลึงของกรดไพรูวิกและแอนะล็อกของกรดแลคติกจำนวนเล็กน้อยได้รับการสังเกตในปัสสาวะและน้ำดี สิ่งเหล่านี้มีกิจกรรมทางชีววิทยาน้อยที่สุด แอนะล็อกของกรดอะซิติกที่พบในเนื้อเยื่อ น้ำดี และปัสสาวะมีกิจกรรมบางอย่าง แต่จะเสื่อมลงอย่างรวดเร็ว ฮอร์โมนไทรอยด์ถูกขับออกทางปัสสาวะและอุจจาระทั้งในรูปแบบอิสระและแบบคอนจูเกต ปฏิกิริยานี้เกี่ยวข้องกับการผันกลูคูโรไนด์และซัลโฟคอนจูเกชัน การผันคำกริยาของ Glucuronide เกิดขึ้นส่วนใหญ่ในตับผ่านทาง microsomal glycuronyl transferase ซัลโฟคอนจูเกชันยังมีความสำคัญในตับ และอาจเป็นขั้นตอนบังคับสำหรับปฏิกิริยาโมโนไดโอดีเนชันของตับ 14 Iodothyronine sulfation ช่วยเพิ่มการขจัดไอโอดีนจากวงแหวนรอบนอกในตับอย่างเห็นได้ชัด ในทารกในครรภ์ที่กิจกรรมดีโอดีเนสของวงแหวนรอบนอกมีพัฒนาการต่ำ เมแทบอไลต์ฮอร์โมนไทรอยด์ที่สำคัญคือคอนจูเกตของซัลเฟตซึ่งไม่ได้ใช้งานทางชีวภาพ (ดู บทที่ 6 .)


เอ็นไซม์: ความหมาย กลไกและการจำแนกประเภท | จุลชีววิทยา

ในบทความนี้เราจะพูดถึง:- 1. คำจำกัดความของเอนไซม์ 2. กลไกการออกฤทธิ์ของเอนไซม์ 3. จลนพลศาสตร์ของเอนไซม์ 4. เอ็นไซม์ Allosteric 5. การจำแนกประเภท 6. ส่วนประกอบ

คำจำกัดความของเอนไซม์:

เอ็นไซม์เป็นโปรตีนที่มีความเชี่ยวชาญสูงซึ่งทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาของระบบชีวภาพ หลุยส์ ปาสเตอร์เป็นคนแรกที่ตระหนักถึงความสำคัญของเอ็นไซม์ในขณะที่ศึกษากระบวนการหมักและระบุว่าเป็น “ferment”-ส่วนสำคัญของเซลล์ที่มีชีวิต

เอ็ดเวิร์ด บุชเนอร์ เป็นผู้ที่สกัดเอ็นไซม์จากเซลล์ยีสต์ในปี พ.ศ. 2440 ซึ่งมีหน้าที่ในการหมักน้ำตาลเป็นแอลกอฮอล์ ในปี 1926 James B. Sumner ได้แยกและตกผลึกยูเรียและยังตั้งสมมติฐานว่าเอนไซม์ทั้งหมดเป็นโปรตีน วันนี้เรารู้แล้วว่านี่เป็นเรื่องจริง แต่ยกเว้นไรโบไซม์ซึ่งเป็น RNA ตัวเร่งปฏิกิริยา

เอ็นไซม์เป็นโปรตีนทรงกลมขนาดใหญ่ที่มีน้ำหนักโมเลกุลตั้งแต่ 13,000 ถึงล้านดาลตัน ประสิทธิภาพการเร่งปฏิกิริยาของเอนไซม์ขึ้นอยู่กับโครงสร้างสามมิติ

นอกจากนี้ ตัวเร่งปฏิกิริยาทางชีวภาพเหล่านี้มีความเฉพาะเจาะจงสูงสำหรับปฏิกิริยาเช่นเดียวกับสภาวะอื่นๆ เช่น เอนไซม์แต่ละตัวมีค่า pH อุณหภูมิ ฯลฯ ที่เหมาะสมที่สุดสำหรับประสิทธิภาพและประสิทธิภาพสูงสุด เอนไซม์บางชนิดต้องการมอยอิตีเพิ่มเติมที่เรียกว่าโคแฟคเตอร์สำหรับกิจกรรมทางชีวภาพ

กลไกการออกฤทธิ์ของเอนไซม์:

เอ็นไซม์ออกฤทธิ์ในการเร่งปฏิกิริยาของปฏิกิริยาทางชีวเคมี พวกมันทำงานบนสารตั้งต้นและก่อตัวเป็นคอมเพล็กซ์หลังจากการโต้ตอบกับเอนไซม์เรียกว่าศูนย์แอคทีฟ เอ็นไซม์และซับสเตรตก่อให้เกิดสารเชิงซ้อนที่ศูนย์แอคทีฟ

การกระทำที่ยึดเหนี่ยวนี้ทำให้ทั้งเอ็นไซม์และซับสเตรตมีความเสถียร ปฏิกิริยาระหว่างซับสเตรตและเอ็นไซม์อาจเป็นพันธะไอออนิกและพันธะไฮโดรเจนหรือแรงแวนเดอร์วาล แอกทีฟไซต์ของเอนไซม์มีหมู่พิเศษบางกลุ่ม เช่น NH2 COOH, -SH เป็นต้น ซึ่งจับซับสเตรตแม้ว่าจะอยู่เหนือพันธะเพื่อสร้างสารประกอบในช่วงเปลี่ยนผ่าน (ระดับกลาง) ที่เรียกว่า enzyme-substrate complex (ES)

ปฏิกิริยานี้เป็นปฏิกิริยา exergonic และปล่อยพลังงานบางส่วนซึ่งเพิ่มระดับพลังงานของโมเลกุลสารตั้งต้น

ดังนั้น การกระตุ้นโมเลกุลของสารตั้งต้นและปรากฏการณ์นี้เรียกว่าพลังงานกระตุ้นหรือพลังงานของการกระตุ้นดังแสดงในรูปที่ 12.10:

ประเภทของกลไกของเอนไซม์:

มีกลไกสองประเภทที่เกี่ยวข้องในการอธิบายการล็อกการก่อตัวเชิงซ้อนของซับสเตรต-เอนไซม์และทฤษฎีสำคัญ (แบบจำลองเทมเพลต) และทฤษฎีความพอดีแบบเหนี่ยวนำ

(i) ทฤษฎีการล็อกและกุญแจ:

Emil Fischer (1894) อธิบายการกระทำเฉพาะของเอนไซม์ที่มีซับสเตรตเดี่ยวโดยใช้ทฤษฎี Lock and Key analog (รูปที่ 12.11) ตามทฤษฎีนี้ ปฏิกิริยาของสถานะย่อยและเอนไซม์นั้นคล้ายคลึงกับการล็อกและกุญแจ

เอ็นไซม์คล้ายกับคีย์ ซึ่งการกำหนดค่าทางเรขาคณิตของซ็อกเก็ตได้รับการแก้ไข ในทำนองเดียวกันพื้นผิวก็มีการกำหนดค่าทางภูมิศาสตร์และสมมาตรเช่นเดียวกับคีย์ ล็อคเฉพาะสามารถเปิดหรือปิดโดยคีย์เฉพาะ ตามสารตั้งต้นเฉพาะนั้นสามารถพบได้ที่บริเวณแอคทีฟของเอ็นไซม์ที่สร้างสารตั้งต้น - เอ็นไซม์คอมเพล็กซ์โดยเฉพาะ

คอมเพล็กซ์ของเอนไซม์-สารตั้งต้นยังคงอยู่ในตำแหน่งที่แน่นและแอคทีฟของเอนไซม์เป็นส่วนเสริมของโมเลกุลของสารตั้งต้น ต่อจากนั้น สารเชิงซ้อนของเอนไซม์-ซับสเตรตส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนแปลงของซับสเตรตไปเป็นการสร้างผลิตภัณฑ์เนื่องจากกิจกรรมของตำแหน่งที่เกิดปฏิกิริยา

เนื่องจากผลิตภัณฑ์มีพลังงานอิสระต่ำกว่าจึงถูกปล่อยออกมา เอ็นไซม์ถูกตรึงเพื่อรับโมเลกุลของซับสเตรตอื่น ดังนั้นกิจกรรมของเอ็นไซม์จึงดำเนินต่อไป ในการเปรียบเทียบนี้ ล็อคคือสารตั้งต้นและกุญแจคือเอนไซม์ เฉพาะกุญแจขนาดที่ถูกต้อง (พื้นผิว) เท่านั้นที่พอดีกับรูกุญแจ (ไซต์ที่ทำงานอยู่) ของตัวล็อค (เอนไซม์)

กุญแจที่เล็กกว่า กุญแจที่ใหญ่กว่า หรือฟันที่วางตำแหน่งไม่ถูกต้องบนกุญแจ (โมเลกุลที่มีรูปร่างหรือขนาดไม่ถูกต้อง) ไม่พอดีกับตัวล็อค (เอนไซม์)

เฉพาะกุญแจที่มีรูปร่างถูกต้องเท่านั้นที่จะเปิดล็อคได้ดังแสดงในรูปที่ 12.11:

(ii) ทฤษฎีความพอดีที่เหนี่ยวนำ:

ในปีพ.ศ. 2501 Koshland ได้ปรับเปลี่ยนแบบจำลอง Fischer's 8217 สำหรับการก่อตัวของสารตั้งต้นของเอนไซม์-สารตั้งต้นเพื่ออธิบายคุณสมบัติของเอนไซม์ได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น ตามแบบจำลองของฟิสเชอร์ ลักษณะของแอกทีฟไซต์ของเอนไซม์นั้นแข็งเกร็ง แต่มันสามารถถูกปรับรูปร่างล่วงหน้าเพื่อให้พอดีกับซับสเตรต

Koshland อธิบายว่าโมเลกุลของเอนไซม์ไม่ได้รักษารูปร่างและโครงสร้างเดิมไว้ แต่การสัมผัสของสารตั้งต้นทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงทางเรขาคณิตบางอย่างในบริเวณที่ทำงานของโมเลกุลของเอนไซม์ โมเลกุลของเอนไซม์ถูกสร้างขึ้นเพื่อให้พอดีกับการกำหนดค่าและศูนย์กลางของสารตั้งต้นของสารตั้งต้น ในเวลาเดียวกัน ส่วนที่เหลือของกรดอะมิโนอาจถูกฝังอยู่ภายในโมเลกุล

ทฤษฎีนี้สามารถอธิบายได้ด้วยภาพประกอบสมมติดังแสดงในรูปที่ 12.12 กลุ่มที่ไม่ชอบน้ำและกลุ่มที่มีประจุทั้งคู่เกี่ยวข้องกับการจับซับสเตรต ฟอสโฟเซอรีน (-P) และกลุ่ม SH ของซิสเทอีนตกค้างมีส่วนร่วมในการเร่งปฏิกิริยา

สารตกค้างของกรดอะมิโนอื่นๆ เช่น ไลซีน (Lys) และเมไทโอนีน (Met) ไม่เกี่ยวข้องกับการจับหรือเร่งปฏิกิริยา ในกรณีที่ไม่มีซับสเตรต กลุ่มการจับกับซับสเตรตและกลุ่มตัวเร่งปฏิกิริยาจะอยู่ห่างจากกัน

แต่การสัมผัสของซับสเตรตทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงเชิงโครงสร้างในโมเลกุลของเอนไซม์และจัดตำแหน่งทั้งสองกลุ่มสำหรับการยึดเกาะของซับสเตรตและตัวเร่งปฏิกิริยา ในขณะเดียวกันการวางแนวเชิงพื้นที่ของภูมิภาคอื่นก็เปลี่ยนไปเช่นกัน ทำให้ไลซีนและเมไทโอนีนใกล้ชิดกันมากขึ้น

จลนพลศาสตร์ของเอนไซม์:

ปัจจุบันมีวิธีการมากมายที่สามารถศึกษากลไกการออกฤทธิ์ของเอนไซม์ รวมถึงความรู้เกี่ยวกับโครงสร้าง 3 มิติที่สมบูรณ์ การกลายพันธุ์ที่ควบคุมสถานที่และวิศวกรรมโปรตีน แนวทางหลักยังคงเป็นการกำหนดอัตราการเกิดปฏิกิริยาและผลกระทบจากพารามิเตอร์การทดลองต่างๆ- แม่นยำยิ่งขึ้น- ‘จลนพลศาสตร์ของเอนไซม์’.

จลนพลศาสตร์ของเอนไซม์เป็นไปตามหลักการของจลนพลศาสตร์ของปฏิกิริยาเคมีทั่วไปอย่างไรและแสดงลักษณะเด่นของการอิ่มตัว (รูปที่ 12.13) ที่ความเข้มข้นของสารตั้งต้นต่ำและความเร็วของปฏิกิริยาเริ่มต้นคือสัดส่วนและสัดส่วนต่อความเข้มข้นของสารตั้งต้น (ปฏิกิริยาลำดับที่ 1) การเพิ่มความเข้มข้นและความเข้มข้นของซับสเตรตเพิ่มเติมไม่ส่งผลต่ออัตราการเกิดปฏิกิริยาและปฏิกิริยาหลังจะกลายเป็นค่าคงที่ (ปฏิกิริยาลำดับศูนย์)

ในทฤษฎีสมมติของปฏิกิริยาสารตั้งต้นที่หนึ่ง ทฤษฎี Michaelis-Menten เอนไซม์จะรวมเข้ากับซับสเตรตตั้งแต่แรกจนถึงจากสารตั้งต้นของเอนไซม์-สารตั้งต้น (ES)

คอมเพล็กซ์ ES นี้จะแตกออกเป็นขั้นตอนที่สองเพื่อปลดปล่อยเอนไซม์และผลิตภัณฑ์อิสระเป็น:

จากสมการข้างต้น ความเร็วเริ่มต้นของปฏิกิริยาสมบูรณ์เท่ากับการสลายตัวของสารตั้งต้นของเอนไซม์ เพราะฉะนั้น,

โดยที่ Vo = ความเร็วเริ่มต้น

(ES) = ความเข้มข้นของสารตั้งต้นของเอนไซม์ที่ซับซ้อน

อย่างไรก็ตาม ทั้งสองพารามิเตอร์ไม่สามารถกำหนดได้โดยตรง และจำเป็นต้องมีนิพจน์ทางเลือกของ Vo ซึ่งสามารถทำได้โดยพิจารณาจากสมการอัตราคำสั่งซื้อ 2″” สำหรับการก่อตัวของ ES จาก E และ S

d(ES)/dt = Ka(E) (S) = Ka[ET] – (ES)] (S) (4)

โดยที่ Ka= ค่าคงที่อัตราลำดับที่สอง

(ET) = ความเข้มข้นของเอนไซม์ทั้งหมด

(ES) = ความเข้มข้นของสารตั้งต้นของเอนไซม์ที่ซับซ้อน

เนื่องจากกำลังพิจารณาการเริ่มต้นของปฏิกิริยา การก่อตัวของ (ES) โดยปฏิกิริยา (2) อาจถูกละเลยเพราะในการเริ่มต้นปฏิกิริยาในทิศทางไปข้างหน้าเมื่อ (S) สูงและ (P) เป็นศูนย์

สมการอัตราสำหรับการเสื่อมสภาพของ ES สามารถแสดงเป็นผลรวมของปฏิกิริยาสองปฏิกิริยา-ปฏิกิริยาแรกให้ผลผลิตและปฏิกิริยาที่สองให้ผล E + S จากนั้น

อย่างไรก็ตาม ในสภาวะคงตัว เมื่ออัตราการก่อตัวของ ES เท่ากับการสลาย สมการ 4 = 5

หรือ Ka [ET]-[ES] (S) = Ka (ES) + Kb (ES)

หรือ [S] [(ET)-(ES)]/(ES) = Ka + Kb/Ka = ​​Km (7)

(Ka+Kb/Ka) กล่าวคือ แสดงเป็น Km เรียกว่า ค่าคงที่ Michaehs-Menten การจัดเรียงสมการใหม่ 7 ให้

ค่าของ (ES) เมื่อแสดงในสมการ:

เมื่อสารตั้งต้นมีความเข้มข้นสูง เอ็นไซม์ทั้งหมดในระบบจะปรากฏเป็น ES complex

ดังนั้นเอ็นไซม์จะอิ่มตัวและไปถึงความเร็วสูงสุด (V max) โดยกำหนดเป็น:

นำค่านี้ไปใส่ในสมการที่ 9 เราจะได้

นี่คือสมการของมิคาเอลิส-เมนเทน นั่นคือ สมการอัตราสำหรับปฏิกิริยาของเอนไซม์สารตั้งต้นหนึ่งตัวเร่งปฏิกิริยาโดยพิจารณากรณีพิเศษเมื่ออัตราการเกิดปฏิกิริยาเริ่มต้นเท่ากับครึ่งหนึ่งของ Vmax พอดี จากนั้นจึงใช้สมการที่ 10

ดังนั้นค่าคงที่มิคาเอลิส-เมนเทนจึงเท่ากับความเข้มข้นของสารตั้งต้นที่ความเร็วปฏิกิริยาเริ่มต้นคือครึ่งหนึ่งของความเร็วสูงสุด

Km แตกต่างกันไปตามพื้นผิว ค่า pH และอุณหภูมิ และไม่ใช่ค่าคงที่

ตอบแทนสมการ 10 เราจะได้

หรือ Wo = Km/Vmax (S) 4- 1 / Vmax (11)

มันคือสมการ Lineweaver-Burk ซึ่งให้เส้นตรงเมื่อ 1/Vo ถูกพล็อตเทียบกับ 1/ S (รูปที่ 12.14)

ผลของ pH และอุณหภูมิและความดันต่อการทำงานของเอนไซม์:

เอ็น&ไชไซม์มีค่า pH และอุณหภูมิที่เหมาะสมที่สุด (หรือช่วง) ที่พวกมันทำงานสูงสุด สายด้านข้างในกรดอะมิโนมีบทบาทสำคัญ โซ่ด้านข้างในบริเวณที่ทำงานอาจทำหน้าที่เป็นกรดหรือเบสอ่อน และการจัดตำแหน่งจะลดสถานะการแตกตัวเป็นไอออน ดังนั้นสถานะไอออไนเซชันจึงมีความสำคัญต่อการกำหนดโครงสร้างของโมเลกุลของเอนไซม์และด้วยเหตุนี้กิจกรรม

ในทำนองเดียวกัน อุณหภูมิที่สูงขึ้นส่งผลให้เกิดการจัดเรียงพันธะใหม่ ด้วยเหตุนี้ โครงสร้างของไซต์ที่ใช้งานอยู่จึงได้รับการเปลี่ยนแปลงและกิจกรรมจะได้รับผลกระทบ เอนไซม์ที่มีซิสเทอีนตกค้างมากกว่าจะมีความเสถียรทางความร้อนมากกว่าเนื่องจากการก่อตัวของสะพาน -S-S ระหว่างสายโซ่เปปไทด์

เอนไซม์อัลโลสเตอริก:

Allosteric (allos = steros อื่น = ไซต์) เป็นเอนไซม์ควบคุม กิจกรรมของตัวเร่งปฏิกิริยาขึ้นอยู่กับการจับที่ไม่ใช่โควาเลนต์ของเมแทบอไลต์จำเพาะที่ไซต์อื่นที่ไม่ใช่ไซต์ที่ทำงานอยู่ ในหลายระบบเอนไซม์ ผลิตภัณฑ์สุดท้ายยับยั้งวิถีโดยการยับยั้งเอนไซม์ของปฏิกิริยาเริ่มต้น ปรากฏการณ์นี้เรียกโดยทั่วไปว่าการยับยั้งการป้อนกลับ

เอ็นไซม์ที่ถูกยับยั้งคือเอ็นไซม์ allosteric ซึ่งรองรับผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้ายบนไซต์ allosteric ปฏิกิริยาของโมดูเลเตอร์ (ผลิตภัณฑ์สุดท้าย) กับไซต์อัลโลสเตอริกเปลี่ยนแปลงโครงสร้างสามมิติของไซต์ตัวเร่งปฏิกิริยาและส่งผลต่อกิจกรรมของมัน โมดูเลเตอร์อาจยับยั้งหรือกระตุ้นเอ็นไซม์อัลโลสเตอริกเป้าหมาย ดังนั้นจึงเรียกว่าโมดูเลเตอร์เชิงลบและบวกตามลำดับ

การจำแนกเอนไซม์:

โดยทั่วไป ชื่อของเอนไซม์จะลงท้ายด้วย ase ต่อท้าย จนกระทั่งเมื่อเร็ว ๆ นี้เอนไซม์ถูกตั้งชื่อตามชื่อของผู้ค้นพบโดยพลการ อย่างไรก็ตาม นี่ไม่ใช่แนวทางปฏิบัติ เนื่องจากเอนไซม์บางตัวมีชื่อที่ไม่เกี่ยวข้องโดยสิ้นเชิง ดังนั้นตอนนี้จึงได้มีการเสนอระบบใหม่เพื่อต่อสู้กับความยากลำบากนี้และเพื่อรวมเอ็นไซม์ใหม่ทั้งหมดที่ถูกค้นพบ

ระบบนี้ได้รับการแนะนำโดย International Committee for Nomenclature of Enzymes ในปี 1973 ระบบนี้ประกอบด้วย 6 คลาสหลัก รวมถึงคลาสย่อยอื่นๆ ตามประเภทของปฏิกิริยาที่เร่งปฏิกิริยา (ตารางที่ 12.2)

ทุกวันนี้ เอนไซม์มักจะถูกกำหนดสองชื่อ: ชื่อที่แนะนำและชื่อที่เป็นระบบ ชื่อที่แนะนำคือชื่อสามัญ มีขนาดเล็กและใช้งานง่าย

ชื่อระบบถูกกำหนดตามปฏิกิริยาในหกคลาสของเอนไซม์:

ส่วนประกอบเอนไซม์:

โดยทั่วไป เอ็นไซม์ประกอบด้วยโปรตีนเพียงอย่างเดียว แต่เอนไซม์จำนวนมากยังมีส่วนที่ไม่ใช่โปรตีนซึ่งจำเป็นสำหรับการทำงานของเอนไซม์ ส่วนโปรตีนของเอนไซม์ในเอนไซม์ประเภทนี้เรียกว่า apoenzyme ส่วนที่ไม่ใช่โปรตีนเรียกว่า cofactor โคแฟกเตอร์อาจเป็นไอออนของโลหะหรือโมเลกุลอินทรีย์ (โคเอ็นไซม์) เอนไซม์ที่สมบูรณ์ที่มีทั้งโคแฟกเตอร์และอะพอเอนไซม์เรียกว่าโฮโลเอ็นไซม์

ในเอ็นไซม์ที่มีไอออนของโลหะเป็นโคแฟกเตอร์คือไอออน เช่น Mg +2 , Fe +2 , Fe +3 , K + เป็นต้น สิ่งเหล่านี้อาจทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาหลักหรือกลุ่มเชื่อมเพื่อจับซับสเตรตและเอ็นไซม์เข้าด้วยกัน เอนไซม์ดังกล่าวที่มีไอออนของโลหะเป็นโคแฟกเตอร์บางครั้งเรียกว่าเมทัลโลเอนไซม์เช่น ฟอสโฟทรานส์เฟอเรส (ซึ่งมี Mg +2 เป็นโคแฟกเตอร์ของโลหะ), ไซโตโครมและคาตาเลส (ซึ่งมีไอออนโลหะ Fe +2 และ Fe +3)

โคเอ็นไซม์ ซึ่งเป็นโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน อาจเป็นวิตามินใดๆ (ติดตามโมเลกุลอินทรีย์ที่มีความสำคัญต่อการทำงานของเซลล์ทั้งหมดและจำเป็นในอาหาร) เมื่อโคเอ็นไซม์จับกับโมเลกุลของเอ็นไซม์อย่างแน่นหนา มักเรียกว่ากลุ่มเทียม โคเอ็นไซม์ที่สำคัญบางชนิด ได้แก่ อนุพันธ์นิโคตินาไมด์, อนุพันธ์ฟลาวิน อะดีนีน ไดนิวคลีโอไทด์ (FAD)


อภิปรายผล

ในการศึกษานี้ เราได้ระบุลักษณะกิจกรรม ATPase และความร่วมมือของแต่ละโดเมน AAA ของ p97

การผูก ATP กับ D1 เป็นข้อกำหนดเบื้องต้นสำหรับกิจกรรม ATPase ภายในของ D2

การกลายพันธุ์ที่บกพร่องซึ่งจับกับนิวคลีโอไทด์ใน D1 (CDC-48.1 K257A ) ไม่แสดงการออกฤทธิ์ของ ATPase ที่ตรวจพบได้ แต่การกลายพันธุ์อื่นๆ ใน D1 ที่ยอมให้การจับ ATP แสดงกิจกรรม ATPase ที่สำคัญ ( รูปที่ 2 ) เนื่องจาก D2 ของ CDC-48.1 K257A จับกับ ATP เช่นเดียวกับโปรตีนชนิดพันธุ์ป่า (รูปที่ S1) การย่อยของ ATP บกพร่องในการกลายพันธุ์ ดังนั้น ATP ไฮโดรไลซิสโดย D2 จึงต้องมีการผูก ATP กับ D1 มีการรายงานผลลัพธ์ที่สม่ำเสมอและไม่สอดคล้องกันโดยใช้สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม p97 (9, 15, 16, 18) นอกจากนี้ . ของเรา ในร่างกาย การวิเคราะห์พบว่าการกลายพันธุ์ของยีสต์ Cdc48p ที่เกี่ยวข้องต้องมีกิจกรรม ATPase อย่างน้อยก็เพียงพอที่จะอยู่รอด แม้ว่าการกลายพันธุ์จะส่งผลต่อการเติบโตของเซลล์อย่างมีนัยสำคัญ (19) ความคลาดเคลื่อนนี้ไม่ได้เกิดจากความแตกต่างของสปีชีส์เพราะรีคอมบิแนนท์ยีสต์ Cdc48p ที่มีการกลายพันธุ์ ซึ่งแสดงและทำให้บริสุทธิ์ในลักษณะเดียวกัน ยังแสดงกิจกรรม ATPase ที่ค่อนข้างต่ำ (ตารางเสริม S1) ค่อนข้างเป็นไปได้ที่โปรตีนอะแดปเตอร์ p97 บางตัว ในร่างกาย (หรือเอฟเฟกเตอร์ที่ปนเปื้อนบางส่วนในตัวอย่างที่ทำให้บริสุทธิ์) ช่วยให้นิวคลีโอไทด์จับกับ D1 หรือเร่งการทำงานของ ATPase ของ D2 แม้ว่า D1 จะอยู่ภายใต้โครงสร้างที่ปราศจากนิวคลีโอไทด์ก็ตาม

โครงสร้างที่ผูกกับ ATP ของกิจกรรม D1 Perturbs D2 ATPase

D1 ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม p97 ชนิดป่าถูกพบเพื่อจับกับ ADP ในโครงสร้างผลึกเท่านั้น (25, 26) การกลายพันธุ์ใน D1 Walker B motif ซึ่งมีแนวโน้มว่าจะหยุดชะงักในสถานะผูกกับ ATP ส่งผลให้ความร่วมมือในเชิงบวกของ D2 และกิจกรรม ATPase ลดลงอย่างมีนัยสำคัญ ( รูปที่ 2 และตารางที่ 1 ) เนื่องจากการกลายพันธุ์ใน Sensor-1 และอาร์จินีนฟิงเกอร์เรซิดิวของ D1 ซึ่งทำปฏิกิริยากับ γ-phosphate ของ ATP ที่ถูกผูกไว้ในกระเป๋าที่มีผลผูกพัน ATP ( รูปที่ 1 NS) ยับยั้งการขาด ATPase ในการกลายพันธุ์ของ D1 Walker B เป็นไปได้ว่าปฏิกิริยาเหล่านี้ใน D1 เป็นสัญญาณสำหรับการยับยั้งกิจกรรม ATPase ของ D2 Briggs และคณะ (18) แสดงให้เห็นว่าทั้งวงแหวน D1 และ D2 สามารถทำหน้าที่อย่างอิสระในแง่ของการจับกับนิวคลีโอไทด์ และเรายังพบโดยการวัดการเรืองแสงของทริปโตเฟนที่แท้จริงด้วยว่า D2 ของ CDC-48.1 E311Q สามารถจับกับ ATP เป็นโปรตีนชนิดธรรมชาติได้ (อาหารเสริม) รูปที่ S1) แสดงว่า D1 ไม่ส่งผลต่อการจับกับนิวคลีโอไทด์กับ D2 เมื่อนำมารวมกัน D1 ควรอยู่ในรูปแบบที่จับกับ ADP สำหรับวงจรไฮโดรไลซิส D2 ATP ปกติ เนื่องจากสถานะที่ผูกกับ ATP ของ D1 ซึ่งรับรู้โดย SRH เรซิดิว อาจรบกวนการสื่อสารระหว่างหน่วยย่อยของ D2 ระหว่างรอบ ATPase

ความร่วมมือเชิงบวกมีความสำคัญต่อฟังก์ชันของ p97 ใน Vivo

เราพบว่าอัตราการเติบโตของเซลล์ยีสต์ที่แสดง Cdc48p กลายพันธุ์นั้นแตกต่างกัน สิ่งที่น่าสนใจที่สุดคืออัตราการเติบโตนั้นสัมพันธ์กับค่าสัมประสิทธิ์ Hill ของการกลายพันธุ์ p97 มากกว่าขนาดของกิจกรรม ATPase เอง ( รูปที่ 5 ) ซึ่งบ่งชี้ว่าความร่วมมือเชิงบวกของ D2 มีความสำคัญต่อ ในร่างกาย หน้าที่ของ p97 เหตุใดความร่วมมือเชิงบวกของ D2 จึงมีความสำคัญต่อการทำงานของ p97 ในการไฮโดรไลซิสของ ATP D2 จะผ่านการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างขนาดใหญ่ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในวงที่หันไปทางรูพรุนของวงแหวน D2 (25) เนื่องจากวงนี้น่าจะมีปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนซับสเตรตมากที่สุด (16) การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของ D2 อาจนำไปสู่การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของโปรตีนซับสเตรต ความเป็นไปได้ประการหนึ่งคือวงจร ATPase ที่ให้ความร่วมมือในเชิงบวกอาจเร่งการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างเหล่านี้ ด้วยเหตุนี้จึงทำให้งานเสร็จในระยะเวลาอันสั้นเพื่อป้องกันไม่ให้พื้นผิวเลื่อนกลับคืนสู่สภาพเดิม

กลไกที่เป็นไปได้ในการควบคุมกิจกรรม Vital D2 ATPase

นอกเหนือจากความร่วมมือในเชิงบวกแล้ว วงจร ATPase ของ D2 ยังได้รับการประสานงานระหว่างหน่วยย่อยด้วย ดังที่เห็นได้จากข้อเท็จจริงที่ว่า ATP & # x003b3S จำนวนเล็กน้อยบน ATP ยับยั้งกิจกรรม D2 ATPase อย่างมาก ( รูปที่ 6 ) เห็นได้ชัดว่าพฤติกรรมนี้แตกต่างจาก ClpX ซึ่งเชื่อว่าจะไฮโดรไลซ์ ATP ในกลไกสุ่ม มีรายงานว่าการเชื่อมโยง ATP ถูกจำกัดไว้ที่ชุดย่อยของหน่วยย่อย D2 (18, 27) อีกกลุ่มหนึ่งแสดงให้เห็นว่าอย่างน้อยสองรูปแบบที่แตกต่างกันถูกสังเกตบนการจับของแอนะล็อก ATP กับ D2 (28) ผลลัพธ์เหล่านี้ไม่รวมกลไกสุ่มและร่วมกันของ p97 แต่มีแนวโน้มว่าวงแหวน D2 จะทำงานตามลำดับ เช่น กลไกแบบต่อเนื่องหรือแบบอื่น

นอกจากนี้เรายังพบว่าการกลายพันธุ์ที่ไม่ร่วมมือยังคงแสดงกิจกรรม ATPase ที่ประสานกัน ( รูปที่ 6 ) ซึ่งบ่งชี้ว่ากลไกที่สร้างความร่วมมือในเชิงบวกและการประสานงานควรแตกต่างกัน กลไกต่างๆ สามารถดำเนินการได้หากโปรโตเมอร์ทั้ง 6 ตัวถูกแบ่งออกเป็น อย่างน้อย สองกลุ่ม เราเสนอสมมติฐานว่า D2 ของโปรโตเมอร์สามตัวซึ่งไม่ได้อยู่ติดกัน ในกลุ่มไฮโดรไลซ์ ATP ในลักษณะที่ประสานกัน แต่ไม่มีความร่วมมือ ( รูปที่ 7 NS). วงจร ATPase ที่ประสานกันนี้โดยโปรโตเมอร์ทางเลือกในเฮกซาเมอร์นั้นเป็นไปได้เพราะ F1 ATPase ใช้กลไกที่คล้ายกัน (29) การทำงานร่วมกันในเชิงบวกสามารถทำได้โดยการเพิ่มการไฮโดรไลซิส ATP ของโปรโตเมอร์ที่อยู่ติดกันหรืออีกอันในเฮกซาเมอร์ซึ่งอยู่ในกลุ่มประสานงานอื่น ( รูปที่ 7 NS). แล้ว D1 มีอิทธิพลต่อการสื่อสารเหล่านี้อย่างไร? โครงสร้างผลึกของชนิด p97 แบบป่าต่อหน้านิวคลีโอไทด์ต่างๆ แสดงให้เห็นว่าหน่วยย่อย D1 ทั้งหมดหกยูนิตถูกครอบครองด้วย ADP (30) ซึ่งช่วยให้เกิดวงจร ATPase ที่ประสานกันและร่วมมือกันของ D2 ( รูปที่ 7 อี). รูปแบบที่ปราศจากนิวคลีโอไทด์ของ D1 ยับยั้งวัฏจักร ATPase ของ D2 ซึ่งบ่งชี้ว่าการจับนิวคลีโอไทด์กับ D1 เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับกิจกรรม ATPase ของ D2 ( รูปที่ 7 ). หากการรวม ATP แต่ไม่ใช่ ADP กับ D1 ของโปรโตเมอร์ยับยั้งการผูกมัด ATP กับ D1 ของโปรโตเมอร์ที่อยู่ติดกัน มีเพียง D1 ของโปรโตเมอร์อื่นอีกสามตัวเท่านั้นที่อยู่ในสถานะที่จับกับนิวคลีโอไทด์ในการกลายพันธุ์ของ D1 Walker B ดังนั้นจึงเปิดใช้งานการประสานงานเพียงรายการเดียว กลุ่ม D2 ( รูปที่ 7 NS). การกลายพันธุ์ของ SRH อาจปลดปล่อยการจับแบบจำกัดนี้ของ ATP และยอมให้การจับ ATP กับโดเมน D1 ทั้งหมดหกโดเมน ซึ่งนำไปสู่การฟื้นฟูรอบ ATPase แบบร่วมมือ ความแตกต่างในการผูกมัด ATP กับ D1 อาจเป็นสาเหตุที่ไม่มีโครงสร้างผลึกที่มีรูปแบบที่จับกับ ATP ของ D1 ที่อธิบายได้ชัดเจน การวิเคราะห์เชิงโครงสร้างเพิ่มเติมของ p97 ในสถานะนิวคลีโอไทด์ต่างๆ และการสังเกตโดยตรงของการเปลี่ยนแปลงเชิงโครงสร้างในระหว่างการไฮโดรไลซิสของ ATP จะให้ข้อมูลเพื่อชี้แจงกลไก และดังที่แสดงให้เห็นเมื่อเร็วๆ นี้ว่าเมทริกซ์ AAA โปรตีเอสในเยื่อหุ้มชั้นในของไมโตคอนเดรียต้องการวัฏจักร ATPase ที่ประสานกันสำหรับการทำงานของมัน (31) ความสำคัญทางชีวภาพของการประสานงานของวัฏจักร p97 ATPase สำหรับการทำงานก็จะเป็นเรื่องที่น่าสนใจเช่นกัน .


ตัวเลือกการเข้าถึง

เข้าถึงวารสารฉบับเต็มเป็นเวลา 1 ปี

ราคาทั้งหมดเป็นราคาสุทธิ
ภาษีมูลค่าเพิ่มจะถูกเพิ่มในภายหลังในการชำระเงิน
การคำนวณภาษีจะสิ้นสุดในขั้นตอนการชำระเงิน

รับสิทธิ์เข้าถึงบทความแบบจำกัดเวลาหรือแบบเต็มบน ReadCube

ราคาทั้งหมดเป็นราคาสุทธิ


Andrew MacMillan

การวิจัยในห้องปฏิบัติการของฉันมุ่งเน้นไปที่เคมีและชีววิทยาของกรดนิวคลีอิก โดยเน้นที่ปฏิกิริยาที่สำคัญทางชีวภาพที่เกี่ยวข้องกับอาร์เอ็นเอ RNA ขนาดใหญ่และเครื่อง ribonucleoprotein ที่ซับซ้อน เช่น spliceosome และ ribosome มีบทบาทสำคัญในกระบวนการเซลล์ที่เป็นส่วนประกอบและควบคุม และในวงจรชีวิตของเชื้อโรคไวรัส ดังนั้นจึงจำเป็นต้องมีข้อมูลโครงสร้างและหน้าที่โดยละเอียดเกี่ยวกับโมเลกุลเหล่านี้ การผสมผสานวิธีการทางชีวฟิสิกส์ เคมี ชีวเคมี และทางชีววิทยาของเซลล์เป็นแนวทางที่มีประสิทธิภาพสำหรับการวิเคราะห์ระบบดังกล่าว สารตั้งต้นกรดนิวคลีอิกดัดแปลง ซึ่งสังเคราะห์โดยใช้ทั้งวิธีการทางเคมีและเอนไซม์ เป็นเครื่องมือตรวจสอบโครงสร้างและปฏิกิริยาของกรดนิวคลีอิกและกรดนิวคลีอิก-โปรตีนเชิงซ้อนที่มีประโยชน์มาก

พื้นที่เฉพาะที่น่าสนใจ ได้แก่ :

  • กลไกของการประกบ pre-mRNA ที่ตัดตอน Intron จากซับสเตรต pre-mRNA เกี่ยวข้องกับปฏิกิริยาทรานส์เอสเทอริฟิเคชันแบบลำดับสองปฏิกิริยาที่เร่งปฏิกิริยาโดย spliceosome ปฏิกิริยาเหล่านี้มีความคล้ายคลึงกันอย่างมากในทางกลไก กับปฏิกิริยาของอินตรอนแบบประกบตัวเอง Group II แม้ว่าความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการระหว่างสองระบบจะไม่ชัดเจน เป็นที่สันนิษฐานกันอย่างกว้างขวางว่าแกนเร่งปฏิกิริยาของ spliceosome เป็นโครงสร้าง RNA แต่ไม่ค่อยมีใครรู้จักเกี่ยวกับกลไกทางเคมีของปฏิกิริยาทรานส์เอสเทอริฟิเคชันหรือโครงสร้างของสารตั้งต้นที่ผูกไว้กับไซต์ที่ทำงานอยู่ เรากำลังแก้ไขปัญหาเหล่านี้โดยการศึกษาโครงสร้าง/ฟังก์ชันที่เกี่ยวข้องกับซับสเตรตการต่อ pre-mRNA ที่ดัดแปลงทางเคมีและปัจจัยการต่อประกบ เรายังใช้การวิเคราะห์โครงสร้างที่มีความละเอียดสูง - X-ray crystallography - เพื่อกำหนดลักษณะโครงสร้างของโปรตีนและโปรตีน-RNA เชิงซ้อนที่เป็นหัวใจของ spliceosome
  • ระเบียบยีน RNA-mediated ขนาดเล็ก แสดงให้เห็นว่า RNA ขนาดเล็กกดขี่หรือปรับเปลี่ยนการแสดงออกของยีนในสิ่งมีชีวิตทั้งหมด ในยูคาริโอตที่สูงกว่า มีกลไกหลายอย่างรวมถึง miRNA ภายนอกและวิถีของ siRNA ที่ต้านไวรัส เรากำลังสำรวจระบบ CRISPR ซึ่งเป็นภูมิคุ้มกันที่ได้รับจากอาร์เอ็นเอขนาดเล็กในแบคทีเรีย ความต้านทานฟาจถูกกำหนดโดยการกำหนดเป้าหมายเฉพาะของกรดนิวคลีอิกจากต่างประเทศโดยระบบเฝ้าระวังแบคทีเรีย เรากำลังใช้วิธีทางชีวเคมีและโครงสร้างเพื่อศึกษากลไกของกระบวนการนี้

สิ่งพิมพ์ที่เลือก:

การอธิบายโครงสร้างของโดเมนหลัก PRP8 จากใจกลางของ spliceosome
Ritchie DB, Schellenberg MJ, Gesner EM, Raithatha SA, สจ๊วต DT, MacMillan AM.
โครงสร้างธรรมชาติ มล. ไบโอล. (2008) 15:1199-1205.


ข้อมูลผู้แต่ง

สังกัด

ภาควิชาจิตวิทยา University of Michigan, Ann Arbor, USA

Kent C Berridge, J Wayne Aldridge & amp Kimberly R Houchard

ภาควิชาประสาทวิทยา University of Michigan, Ann Arbor, USA

Wayne State University Medical School เมืองดีทรอยต์ สหรัฐอเมริกา

ภาควิชาประสาทชีววิทยา เภสัชวิทยา และสรีรวิทยา University of Chicago, Chicago, USA

คุณยังสามารถค้นหาผู้เขียนคนนี้ใน PubMed Google Scholar

คุณยังสามารถค้นหาผู้เขียนคนนี้ใน PubMed Google Scholar

คุณยังสามารถค้นหาผู้เขียนคนนี้ใน PubMed Google Scholar

คุณยังสามารถค้นหาผู้เขียนคนนี้ใน PubMed Google Scholar

ผู้เขียนที่สอดคล้องกัน


1.10. ระบบเอนไซม์พืชและสาหร่าย

อาหารจากพืชมักบริโภคในรูปแบบดิบ [68] ซึ่งช่วยลดความกังวลหลักเกี่ยวกับเอนไซม์จากสัตว์โดยการรักษาความสมบูรณ์ของเอนไซม์เอง นอกจากนี้ เอนไซม์ย่อยอาหารจากพืชยังมีประสิทธิภาพเหนือระดับ pH ในวงกว้าง ช่วงนี้มักจะอยู่ระหว่าง 3.0 ถึง 9.0 ซึ่งเข้ากันได้ดีกับสภาพแวดล้อมทางเดินอาหารของมนุษย์ [55–72] ดังนั้นเอนไซม์จากพืชจึงเข้ากันได้สำหรับการสนับสนุนสุขภาพทางเดินอาหารที่ครอบคลุม โปรตีเอส อะไมเลส ไลเปส และเซลลูโลสเป็นเอนไซม์ที่สำคัญและมีอยู่ในพืช โปรตีเอสสลายโปรตีนที่มีอยู่ในเนื้อสัตว์ ปลา สัตว์ปีก ไข่ ชีส และถั่ว อะไมเลสช่วยให้ร่างกายของคุณมีการสลายตัวและการดูดซึมคาร์โบไฮเดรตและแป้งตามมา ไลเปสช่วยในการย่อยไขมัน เมื่ออาหารของคุณรวมถึงอาหารที่อุดมด้วยไลเปส จะช่วยลดภาระการผลิตถุงน้ำดี ตับ และตับอ่อน เซลลูเลส มีอยู่ในผลไม้และผักหลายชนิด และทำลายเส้นใยอาหาร ซึ่งเพิ่มคุณค่าทางโภชนาการให้กับร่างกายของเรา การปรากฏตัวของ เซลลูเลส ในแหล่งที่มีพืชเป็นหลักมีความสำคัญ เนื่องจากไม่มีอยู่ในร่างกายมนุษย์ตามธรรมชาติ ผักและผลไม้เป็นแหล่งที่เหมาะสำหรับเอนไซม์ พวกมันอุดมไปด้วยเอนไซม์และบริโภคได้ง่ายโดยไม่จำเป็นต้องปรุงหรือแปรรูป สุดท้ายก็รักษาฟังก์ชันการทำงานของเอนไซม์ไว้ได้ครบถ้วน โดยใช้เทคโนโลยีชีวภาพของพืช สามารถผลิตเอ็นไซม์หลายชนิดจากพืชรวมทั้งแหล่งสาหร่าย [56–72]

ในระหว่างการสังเคราะห์ด้วยแสงของสาหร่าย โปรตีนและเอ็นไซม์ต่างๆ จะถูกสร้างขึ้นซึ่งสามารถนำไปใช้ในการพัฒนาเศรษฐกิจและการจัดการสิ่งแวดล้อม เช่น ในการบำบัดน้ำเสีย การผลิตสารเคมีที่ดี และการผลิตไบโอดีเซล [56–72] เนื่องจากศักยภาพของพวกมันในการจับและแก้ไขคาร์บอนไดออกไซด์โดยใช้พลังงานแสงอาทิตย์ สาหร่ายทะเลที่สังเคราะห์แสงจึงถือเป็นแบบจำลองที่มีศักยภาพสำหรับการผลิตโปรตีน เมื่อเร็ว ๆ นี้ได้มีการตั้งข้อสังเกตว่าคลอโรพลาสต์ของสาหร่ายสามารถเปลี่ยนรูปเป็นโปรตีนรีคอมบิแนนท์สำหรับการผลิตได้ [55] เอนไซม์รีคอมบิแนนท์ห้าประเภทที่แตกต่างกัน ไซลาเนส, α-galactosidase, ไฟเตส, ฟอสเฟตแอนไฮโดรเลส, และ เบต้า-มานาเนส D. tertiolecta หรือ C. reinhardtii อยู่ในพลาสมิดของ ง. tertiolecta หรือ ค. ไรน์ฮาร์ดที. กลยุทธ์ที่คล้ายคลึงกันควรทำให้เกิดการผลิตโปรตีนลูกผสมในสาหร่ายทะเลหลายชนิด [55]


ดูวิดีโอ: ชวะ 16 (มิถุนายน 2022).