ข้อมูล

มีความแตกต่างระหว่างคำศัพท์เหล่านี้สำหรับโปรตีนหรือไม่: "โครงสร้างผลึก" "โครงสร้าง NMR" "โครงสร้างโซลูชัน" และ "โครงสร้างที่ซับซ้อน"

มีความแตกต่างระหว่างคำศัพท์เหล่านี้สำหรับโปรตีนหรือไม่:



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

การบ้านของฉันต้องการให้ฉันวาดโครงสร้างผลึกทั้งหมดที่กำหนดต่อปี แต่เมื่อฉันค้นหาโครงสร้างทั้งหมดบน PDB บทความจำนวนมากบอกว่า "โครงสร้างผลึก" แต่บางคนบอกว่า "โครงสร้างโซลูชัน" หรือแม้แต่ "โครงสร้างที่ซับซ้อน" สิ่งเหล่านี้ถือเป็นส่วนย่อยของ "โครงสร้างผลึก" หรือไม่?


ขึ้นอยู่กับว่าคุณคุยกับใคร (โดยทั่วไปคือฆราวาสและนักวิทยาศาสตร์ที่ไม่ใช่นักชีวเคมีเชิงโครงสร้าง) คำว่า "โครงสร้างคริสตัล" มักหมายถึง "การกำหนดโครงสร้างโมเลกุลบางอย่างไม่ว่าจะโดยผลึกศาสตร์จริงหรือวิธีการอื่น".

ตัวอย่างเช่น นักศึกษาระดับบัณฑิตศึกษากำลังพูดคุยกับที่ปรึกษาของเธอ นักภูมิคุ้มกันวิทยา เกี่ยวกับความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและหน้าที่ระหว่างโปรตีน capsid ของไวรัสกับแอนติเจนเปปไทด์ที่พวกเขาใช้เพื่อสร้างครอบครัวของแอนติบอดีต่อไวรัส ที่ปรึกษาอ้างถึง "โครงสร้างผลึก" ที่เผยแพร่เมื่อเร็ว ๆ นี้อย่างสม่ำเสมอแม้ว่าการศึกษาจริงจะดำเนินการโดยใช้สเปกตรัม NMR ที่ได้รับจากสารละลายกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนและเทคนิคการสร้างแบบจำลองเคมีเชิงควอนตัมเชิงควอนตัมและไม่มีผลึกใด ๆ ศึกษา

ดังนั้น คุณอาจต้องการพูดคุยกับครู/อาจารย์ของคุณและชี้แจงสิ่งที่เขา/เขากำลังมองหา เป็นไปได้มากว่าถ้าคุณอยู่ในระดับปริญญาตรีหรือระดับบัณฑิตศึกษาปีแรก พวกเขากำลังมองหา "การกำหนดโครงสร้าง" โดยทั่วไป แต่พวกเขาอาจมองหาแบบจำลองที่สร้างขึ้นโดยใช้คริสตัลจริงโดยเฉพาะ ดังนั้นขอให้ถาม ดีที่สุดเสมอ

ฉันควรสังเกตว่ามีความแตกต่างของระเบียบวิธีและการคำนวณอย่างมีนัยสำคัญเมื่อกำหนดโครงสร้างผ่านผลึกศาสตร์เอ็กซ์เรย์, NMR ประเภทต่างๆ, กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน (มีหรือไม่มีคริสตัลเป็นเป้าหมาย), การคำนวณที่ "ซับซ้อน" เป็นต้น นักชีววิทยาที่จะเรียนรู้มากขึ้นอีกมาก


ฉันเห็นด้วยกับสิ่งที่ MattDMo พูด แต่เพื่อเน้นย้ำว่า โครงสร้าง 'โซลูชัน' หรือ 'NMR' ไม่ใช่โครงสร้างผลึก ('โครงสร้างที่ซับซ้อน' อาจหมายถึงโครงสร้างของสารเชิงซ้อน เช่น ระหว่างโปรตีนกับลิแกนด์) เพื่อเป็นโครงสร้างผลึก โครงสร้างควรถูกกำหนดโดยใช้ผลึกศาสตร์เอ็กซ์เรย์

จากหน้าแรกของ Protein Data Bank ให้เลือก การค้นหาขั้นสูง.

จากนั้นใช้เมนูแบบเลื่อนลง เลือกประเภทแบบสอบถาม: เลือก วิธีทดลอง. สิ่งนี้จะเติมโดยอัตโนมัติด้วย เอกซเรย์ ตัวเลือกที่คุณต้องการ - ดูที่ตัวเลือกอื่น ๆ

คุณสามารถใช้ เพิ่มเกณฑ์การค้นหา เพื่อผนวกฟิลด์ใหม่ที่คุณสามารถเลือกช่วงวันที่


ดูวิดีโอ: 290. David Eberhard, Skillnaden Mellan Kvinnor och Män. Framgångspodden. Hel intervju (สิงหาคม 2022).